Protein–RNA interactions for Protein: P51793

CLCN4, H(+)/Cl(-) exchange transporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 760 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCN4P51793 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CLCN4P51793 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CLCN4P51793 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CLCN4P51793 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
CLCN4P51793 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CLCN4P51793 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CLCN4P51793 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CLCN4P51793 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CLCN4P51793 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CLCN4P51793 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CLCN4P51793 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CLCN4P51793 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CLCN4P51793 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC28■■■□□ 2.07
CLCN4P51793 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC28■■■□□ 2.07
CLCN4P51793 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC28■■■□□ 2.07
CLCN4P51793 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC28■■■□□ 2.07
CLCN4P51793 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC28■■■□□ 2.07
CLCN4P51793 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC28■■■□□ 2.07
CLCN4P51793 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC28■■■□□ 2.07
CLCN4P51793 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC28■■■□□ 2.07
CLCN4P51793 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC28■■■□□ 2.07
CLCN4P51793 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CLCN4P51793 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CLCN4P51793 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
CLCN4P51793 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CLCN4P51793 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CLCN4P51793 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CLCN4P51793 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CLCN4P51793 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CLCN4P51793 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CLCN4P51793 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CLCN4P51793 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CLCN4P51793 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CLCN4P51793 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CLCN4P51793 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CLCN4P51793 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CLCN4P51793 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CLCN4P51793 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
CLCN4P51793 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CLCN4P51793 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CLCN4P51793 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CLCN4P51793 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CLCN4P51793 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CLCN4P51793 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CLCN4P51793 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CLCN4P51793 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CLCN4P51793 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CLCN4P51793 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CLCN4P51793 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CLCN4P51793 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CLCN4P51793 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CLCN4P51793 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CLCN4P51793 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CLCN4P51793 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CLCN4P51793 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CLCN4P51793 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CLCN4P51793 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CLCN4P51793 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CLCN4P51793 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CLCN4P51793 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CLCN4P51793 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CLCN4P51793 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CLCN4P51793 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CLCN4P51793 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CLCN4P51793 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CLCN4P51793 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CLCN4P51793 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CLCN4P51793 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CLCN4P51793 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CLCN4P51793 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CLCN4P51793 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CLCN4P51793 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CLCN4P51793 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CLCN4P51793 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
CLCN4P51793 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CLCN4P51793 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CLCN4P51793 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CLCN4P51793 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CLCN4P51793 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CLCN4P51793 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CLCN4P51793 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CLCN4P51793 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CLCN4P51793 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CLCN4P51793 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CLCN4P51793 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CLCN4P51793 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CLCN4P51793 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CLCN4P51793 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CLCN4P51793 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CLCN4P51793 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CLCN4P51793 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CLCN4P51793 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CLCN4P51793 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CLCN4P51793 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CLCN4P51793 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CLCN4P51793 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CLCN4P51793 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CLCN4P51793 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CLCN4P51793 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CLCN4P51793 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms