Protein–RNA interactions for Protein: P51531

SMARCA2, Probable global transcription activator SNF2L2, humanhuman

Predictions only

Length 1,590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA2P51531 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.25■■■■■ 5.32
SMARCA2P51531 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC48.25■■■■■ 5.31
SMARCA2P51531 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC48.24■■■■■ 5.31
SMARCA2P51531 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC48.24■■■■■ 5.31
SMARCA2P51531 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC48.23■■■■■ 5.31
SMARCA2P51531 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC48.22■■■■■ 5.31
SMARCA2P51531 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC48.22■■■■■ 5.31
SMARCA2P51531 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC48.22■■■■■ 5.31
SMARCA2P51531 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC48.22■■■■■ 5.31
SMARCA2P51531 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC48.21■■■■■ 5.31
SMARCA2P51531 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC48.21■■■■■ 5.31
SMARCA2P51531 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC48.21■■■■■ 5.31
SMARCA2P51531 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC48.2■■■■■ 5.31
SMARCA2P51531 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC48.2■■■■■ 5.31
SMARCA2P51531 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC48.2■■■■■ 5.31
SMARCA2P51531 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC48.2■■■■■ 5.31
SMARCA2P51531 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC48.2■■■■■ 5.31
SMARCA2P51531 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC48.2■■■■■ 5.31
SMARCA2P51531 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC48.2■■■■■ 5.31
SMARCA2P51531 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC48.2■■■■■ 5.31
SMARCA2P51531 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC48.19■■■■■ 5.3
SMARCA2P51531 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC48.17■■■■■ 5.3
SMARCA2P51531 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC48.16■■■■■ 5.3
SMARCA2P51531 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC48.16■■■■■ 5.3
SMARCA2P51531 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.16■■■■■ 5.3
SMARCA2P51531 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.15■■■■■ 5.3
SMARCA2P51531 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC48.15■■■■■ 5.3
SMARCA2P51531 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC48.13■■■■■ 5.3
SMARCA2P51531 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.11■■■■■ 5.29
SMARCA2P51531 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC48.1■■■■■ 5.29
SMARCA2P51531 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC48.1■■■■■ 5.29
SMARCA2P51531 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC48.06■■■■■ 5.28
SMARCA2P51531 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC48.03■■■■■ 5.28
SMARCA2P51531 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.03■■■■■ 5.28
SMARCA2P51531 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC48.02■■■■■ 5.28
SMARCA2P51531 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.02■■■■■ 5.28
SMARCA2P51531 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC48.01■■■■■ 5.28
SMARCA2P51531 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.01■■■■■ 5.28
SMARCA2P51531 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC48■■■■■ 5.28
SMARCA2P51531 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC47.99■■■■■ 5.27
SMARCA2P51531 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC47.98■■■■■ 5.27
SMARCA2P51531 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.98■■■■■ 5.27
SMARCA2P51531 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC47.98■■■■■ 5.27
SMARCA2P51531 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC47.94■■■■■ 5.26
SMARCA2P51531 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC47.93■■■■■ 5.26
SMARCA2P51531 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.93■■■■■ 5.26
SMARCA2P51531 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.92■■■■■ 5.26
SMARCA2P51531 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC47.92■■■■■ 5.26
SMARCA2P51531 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC47.92■■■■■ 5.26
SMARCA2P51531 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC47.92■■■■■ 5.26
SMARCA2P51531 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC47.92■■■■■ 5.26
SMARCA2P51531 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC47.92■■■■■ 5.26
SMARCA2P51531 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC47.92■■■■■ 5.26
SMARCA2P51531 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC47.91■■■■■ 5.26
SMARCA2P51531 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC47.91■■■■■ 5.26
SMARCA2P51531 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC47.86■■■■■ 5.25
SMARCA2P51531 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC47.85■■■■■ 5.25
SMARCA2P51531 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.84■■■■■ 5.25
SMARCA2P51531 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC47.84■■■■■ 5.25
SMARCA2P51531 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC47.82■■■■■ 5.24
SMARCA2P51531 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC47.79■■■■■ 5.24
SMARCA2P51531 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC47.79■■■■■ 5.24
SMARCA2P51531 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC47.77■■■■■ 5.24
SMARCA2P51531 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.76■■■■■ 5.24
SMARCA2P51531 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC47.76■■■■■ 5.24
SMARCA2P51531 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC47.75■■■■■ 5.24
SMARCA2P51531 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC47.75■■■■■ 5.23
SMARCA2P51531 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC47.75■■■■■ 5.23
SMARCA2P51531 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC47.72■■■■■ 5.23
SMARCA2P51531 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC47.71■■■■■ 5.23
SMARCA2P51531 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC47.71■■■■■ 5.23
SMARCA2P51531 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC47.71■■■■■ 5.23
SMARCA2P51531 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC47.71■■■■■ 5.23
SMARCA2P51531 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC47.7■■■■■ 5.23
SMARCA2P51531 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC47.7■■■■■ 5.23
SMARCA2P51531 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC47.69■■■■■ 5.23
SMARCA2P51531 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC47.69■■■■■ 5.22
SMARCA2P51531 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC47.68■■■■■ 5.22
SMARCA2P51531 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC47.66■■■■■ 5.22
SMARCA2P51531 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC47.66■■■■■ 5.22
SMARCA2P51531 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC47.65■■■■■ 5.22
SMARCA2P51531 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC47.62■■■■■ 5.21
SMARCA2P51531 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC47.62■■■■■ 5.21
SMARCA2P51531 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.62■■■■■ 5.21
SMARCA2P51531 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC47.61■■■■■ 5.21
SMARCA2P51531 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC47.61■■■■■ 5.21
SMARCA2P51531 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC47.59■■■■■ 5.21
SMARCA2P51531 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC47.58■■■■■ 5.21
SMARCA2P51531 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC47.58■■■■■ 5.21
SMARCA2P51531 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC47.58■■■■■ 5.21
SMARCA2P51531 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC47.56■■■■■ 5.2
SMARCA2P51531 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.55■■■■■ 5.2
SMARCA2P51531 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC47.55■■■■■ 5.2
SMARCA2P51531 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC47.54■■■■■ 5.2
SMARCA2P51531 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC47.54■■■■■ 5.2
SMARCA2P51531 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC47.53■■■■■ 5.2
SMARCA2P51531 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC47.53■■■■■ 5.2
SMARCA2P51531 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC47.52■■■■■ 5.2
SMARCA2P51531 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC47.52■■■■■ 5.2
SMARCA2P51531 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC47.52■■■■■ 5.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms