Protein–RNA interactions for Protein: P50395

GDI2, Rab GDP dissociation inhibitor beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDI2P50395 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GDI2P50395 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GDI2P50395 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GDI2P50395 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GDI2P50395 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GDI2P50395 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GDI2P50395 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
GDI2P50395 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GDI2P50395 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GDI2P50395 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GDI2P50395 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GDI2P50395 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
GDI2P50395 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GDI2P50395 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GDI2P50395 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GDI2P50395 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GDI2P50395 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GDI2P50395 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GDI2P50395 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GDI2P50395 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
GDI2P50395 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GDI2P50395 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GDI2P50395 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GDI2P50395 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GDI2P50395 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GDI2P50395 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GDI2P50395 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GDI2P50395 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GDI2P50395 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GDI2P50395 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GDI2P50395 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GDI2P50395 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GDI2P50395 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
GDI2P50395 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GDI2P50395 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GDI2P50395 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GDI2P50395 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GDI2P50395 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GDI2P50395 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
GDI2P50395 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
GDI2P50395 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GDI2P50395 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GDI2P50395 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GDI2P50395 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GDI2P50395 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GDI2P50395 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GDI2P50395 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GDI2P50395 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GDI2P50395 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GDI2P50395 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GDI2P50395 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GDI2P50395 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GDI2P50395 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GDI2P50395 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GDI2P50395 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GDI2P50395 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GDI2P50395 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GDI2P50395 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GDI2P50395 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GDI2P50395 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GDI2P50395 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GDI2P50395 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GDI2P50395 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
GDI2P50395 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GDI2P50395 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GDI2P50395 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GDI2P50395 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GDI2P50395 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GDI2P50395 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GDI2P50395 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GDI2P50395 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GDI2P50395 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
GDI2P50395 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GDI2P50395 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GDI2P50395 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GDI2P50395 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GDI2P50395 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GDI2P50395 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GDI2P50395 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GDI2P50395 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GDI2P50395 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GDI2P50395 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GDI2P50395 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GDI2P50395 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GDI2P50395 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GDI2P50395 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GDI2P50395 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GDI2P50395 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GDI2P50395 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GDI2P50395 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GDI2P50395 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
GDI2P50395 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GDI2P50395 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GDI2P50395 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GDI2P50395 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GDI2P50395 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GDI2P50395 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GDI2P50395 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GDI2P50395 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GDI2P50395 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.3 ms