Protein–RNA interactions for Protein: P50213

IDH3A, Isocitrate dehydrogenase [NAD] subunit alpha, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IDH3AP50213 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
IDH3AP50213 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
IDH3AP50213 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
IDH3AP50213 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
IDH3AP50213 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
IDH3AP50213 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
IDH3AP50213 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
IDH3AP50213 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
IDH3AP50213 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
IDH3AP50213 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
IDH3AP50213 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
IDH3AP50213 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
IDH3AP50213 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
IDH3AP50213 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
IDH3AP50213 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
IDH3AP50213 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
IDH3AP50213 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
IDH3AP50213 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
IDH3AP50213 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
IDH3AP50213 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
IDH3AP50213 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
IDH3AP50213 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
IDH3AP50213 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
IDH3AP50213 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
IDH3AP50213 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
IDH3AP50213 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
IDH3AP50213 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
IDH3AP50213 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
IDH3AP50213 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
IDH3AP50213 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
IDH3AP50213 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
IDH3AP50213 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
IDH3AP50213 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
IDH3AP50213 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
IDH3AP50213 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
IDH3AP50213 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
IDH3AP50213 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
IDH3AP50213 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
IDH3AP50213 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
IDH3AP50213 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
IDH3AP50213 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
IDH3AP50213 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
IDH3AP50213 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
IDH3AP50213 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
IDH3AP50213 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
IDH3AP50213 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
IDH3AP50213 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
IDH3AP50213 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
IDH3AP50213 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
IDH3AP50213 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
IDH3AP50213 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
IDH3AP50213 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
IDH3AP50213 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
IDH3AP50213 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
IDH3AP50213 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
IDH3AP50213 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
IDH3AP50213 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
IDH3AP50213 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
IDH3AP50213 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
IDH3AP50213 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
IDH3AP50213 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
IDH3AP50213 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
IDH3AP50213 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
IDH3AP50213 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
IDH3AP50213 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
IDH3AP50213 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
IDH3AP50213 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
IDH3AP50213 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
IDH3AP50213 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
IDH3AP50213 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
IDH3AP50213 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
IDH3AP50213 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
IDH3AP50213 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
IDH3AP50213 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
IDH3AP50213 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
IDH3AP50213 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
IDH3AP50213 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
IDH3AP50213 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
IDH3AP50213 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
IDH3AP50213 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
IDH3AP50213 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
IDH3AP50213 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
IDH3AP50213 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
IDH3AP50213 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
IDH3AP50213 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
IDH3AP50213 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
IDH3AP50213 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
IDH3AP50213 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
IDH3AP50213 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
IDH3AP50213 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
IDH3AP50213 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
IDH3AP50213 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
IDH3AP50213 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
IDH3AP50213 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
IDH3AP50213 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
IDH3AP50213 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
IDH3AP50213 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
IDH3AP50213 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
IDH3AP50213 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
IDH3AP50213 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms