Protein–RNA interactions for Protein: P50120

RBP2, Retinol-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBP2P50120 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RBP2P50120 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RBP2P50120 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RBP2P50120 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RBP2P50120 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RBP2P50120 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
RBP2P50120 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RBP2P50120 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RBP2P50120 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RBP2P50120 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RBP2P50120 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RBP2P50120 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RBP2P50120 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RBP2P50120 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RBP2P50120 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RBP2P50120 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RBP2P50120 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RBP2P50120 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RBP2P50120 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RBP2P50120 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RBP2P50120 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
RBP2P50120 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RBP2P50120 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RBP2P50120 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RBP2P50120 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RBP2P50120 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
RBP2P50120 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RBP2P50120 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RBP2P50120 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RBP2P50120 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RBP2P50120 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RBP2P50120 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RBP2P50120 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RBP2P50120 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RBP2P50120 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RBP2P50120 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RBP2P50120 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RBP2P50120 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RBP2P50120 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RBP2P50120 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RBP2P50120 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RBP2P50120 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RBP2P50120 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
RBP2P50120 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RBP2P50120 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RBP2P50120 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RBP2P50120 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RBP2P50120 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RBP2P50120 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RBP2P50120 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
RBP2P50120 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
RBP2P50120 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RBP2P50120 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RBP2P50120 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RBP2P50120 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RBP2P50120 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RBP2P50120 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RBP2P50120 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RBP2P50120 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RBP2P50120 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RBP2P50120 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RBP2P50120 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RBP2P50120 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RBP2P50120 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RBP2P50120 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RBP2P50120 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RBP2P50120 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RBP2P50120 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RBP2P50120 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RBP2P50120 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RBP2P50120 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RBP2P50120 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RBP2P50120 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RBP2P50120 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RBP2P50120 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RBP2P50120 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RBP2P50120 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
RBP2P50120 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
RBP2P50120 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RBP2P50120 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RBP2P50120 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RBP2P50120 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RBP2P50120 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RBP2P50120 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RBP2P50120 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RBP2P50120 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RBP2P50120 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RBP2P50120 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RBP2P50120 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RBP2P50120 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RBP2P50120 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RBP2P50120 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RBP2P50120 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RBP2P50120 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RBP2P50120 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RBP2P50120 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RBP2P50120 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RBP2P50120 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RBP2P50120 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RBP2P50120 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103 ms