Protein–RNA interactions for Protein: P49918

CDKN1C, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN1CP49918 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CDKN1CP49918 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CDKN1CP49918 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CDKN1CP49918 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CDKN1CP49918 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
CDKN1CP49918 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CDKN1CP49918 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CDKN1CP49918 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CDKN1CP49918 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CDKN1CP49918 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CDKN1CP49918 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CDKN1CP49918 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
CDKN1CP49918 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CDKN1CP49918 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CDKN1CP49918 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CDKN1CP49918 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CDKN1CP49918 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CDKN1CP49918 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CDKN1CP49918 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
CDKN1CP49918 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CDKN1CP49918 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CDKN1CP49918 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CDKN1CP49918 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CDKN1CP49918 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CDKN1CP49918 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CDKN1CP49918 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
CDKN1CP49918 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CDKN1CP49918 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CDKN1CP49918 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CDKN1CP49918 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CDKN1CP49918 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CDKN1CP49918 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CDKN1CP49918 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CDKN1CP49918 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
CDKN1CP49918 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CDKN1CP49918 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CDKN1CP49918 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CDKN1CP49918 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CDKN1CP49918 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CDKN1CP49918 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CDKN1CP49918 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CDKN1CP49918 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CDKN1CP49918 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CDKN1CP49918 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CDKN1CP49918 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
CDKN1CP49918 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
CDKN1CP49918 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CDKN1CP49918 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
CDKN1CP49918 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CDKN1CP49918 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CDKN1CP49918 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CDKN1CP49918 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CDKN1CP49918 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CDKN1CP49918 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CDKN1CP49918 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CDKN1CP49918 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CDKN1CP49918 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CDKN1CP49918 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CDKN1CP49918 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CDKN1CP49918 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CDKN1CP49918 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CDKN1CP49918 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CDKN1CP49918 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CDKN1CP49918 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CDKN1CP49918 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CDKN1CP49918 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CDKN1CP49918 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CDKN1CP49918 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CDKN1CP49918 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CDKN1CP49918 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CDKN1CP49918 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CDKN1CP49918 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
CDKN1CP49918 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CDKN1CP49918 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CDKN1CP49918 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CDKN1CP49918 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CDKN1CP49918 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CDKN1CP49918 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CDKN1CP49918 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CDKN1CP49918 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CDKN1CP49918 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CDKN1CP49918 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CDKN1CP49918 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CDKN1CP49918 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CDKN1CP49918 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CDKN1CP49918 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CDKN1CP49918 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CDKN1CP49918 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CDKN1CP49918 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CDKN1CP49918 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
CDKN1CP49918 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CDKN1CP49918 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CDKN1CP49918 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
CDKN1CP49918 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CDKN1CP49918 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CDKN1CP49918 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CDKN1CP49918 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CDKN1CP49918 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CDKN1CP49918 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CDKN1CP49918 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms