Protein–RNA interactions for Protein: P49908

SELENOP, Selenoprotein P, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SELENOPP49908 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SELENOPP49908 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SELENOPP49908 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SELENOPP49908 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SELENOPP49908 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SELENOPP49908 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SELENOPP49908 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SELENOPP49908 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SELENOPP49908 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SELENOPP49908 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SELENOPP49908 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SELENOPP49908 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SELENOPP49908 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SELENOPP49908 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SELENOPP49908 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SELENOPP49908 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SELENOPP49908 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SELENOPP49908 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SELENOPP49908 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SELENOPP49908 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SELENOPP49908 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SELENOPP49908 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SELENOPP49908 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SELENOPP49908 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SELENOPP49908 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SELENOPP49908 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SELENOPP49908 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SELENOPP49908 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SELENOPP49908 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SELENOPP49908 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SELENOPP49908 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SELENOPP49908 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SELENOPP49908 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SELENOPP49908 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SELENOPP49908 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SELENOPP49908 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SELENOPP49908 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SELENOPP49908 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SELENOPP49908 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SELENOPP49908 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SELENOPP49908 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SELENOPP49908 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SELENOPP49908 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SELENOPP49908 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SELENOPP49908 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SELENOPP49908 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SELENOPP49908 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SELENOPP49908 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SELENOPP49908 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SELENOPP49908 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SELENOPP49908 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SELENOPP49908 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SELENOPP49908 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SELENOPP49908 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SELENOPP49908 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SELENOPP49908 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SELENOPP49908 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SELENOPP49908 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SELENOPP49908 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SELENOPP49908 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SELENOPP49908 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SELENOPP49908 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SELENOPP49908 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SELENOPP49908 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SELENOPP49908 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SELENOPP49908 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
SELENOPP49908 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SELENOPP49908 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SELENOPP49908 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SELENOPP49908 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SELENOPP49908 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SELENOPP49908 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SELENOPP49908 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SELENOPP49908 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SELENOPP49908 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SELENOPP49908 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SELENOPP49908 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SELENOPP49908 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SELENOPP49908 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SELENOPP49908 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SELENOPP49908 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SELENOPP49908 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SELENOPP49908 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SELENOPP49908 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SELENOPP49908 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SELENOPP49908 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SELENOPP49908 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SELENOPP49908 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SELENOPP49908 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SELENOPP49908 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SELENOPP49908 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SELENOPP49908 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SELENOPP49908 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SELENOPP49908 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SELENOPP49908 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SELENOPP49908 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SELENOPP49908 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SELENOPP49908 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SELENOPP49908 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SELENOPP49908 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms