Protein–RNA interactions for Protein: P49768

PSEN1, Presenilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSEN1P49768 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PSEN1P49768 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PSEN1P49768 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PSEN1P49768 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PSEN1P49768 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PSEN1P49768 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PSEN1P49768 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PSEN1P49768 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PSEN1P49768 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PSEN1P49768 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PSEN1P49768 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PSEN1P49768 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PSEN1P49768 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PSEN1P49768 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PSEN1P49768 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PSEN1P49768 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PSEN1P49768 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PSEN1P49768 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PSEN1P49768 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PSEN1P49768 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PSEN1P49768 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PSEN1P49768 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PSEN1P49768 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PSEN1P49768 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PSEN1P49768 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PSEN1P49768 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PSEN1P49768 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
PSEN1P49768 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PSEN1P49768 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PSEN1P49768 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PSEN1P49768 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PSEN1P49768 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PSEN1P49768 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PSEN1P49768 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PSEN1P49768 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PSEN1P49768 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PSEN1P49768 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PSEN1P49768 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PSEN1P49768 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PSEN1P49768 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PSEN1P49768 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PSEN1P49768 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PSEN1P49768 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PSEN1P49768 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
PSEN1P49768 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PSEN1P49768 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
PSEN1P49768 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC27.57■■■□□ 2
PSEN1P49768 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.57■■■□□ 2
PSEN1P49768 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
PSEN1P49768 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PSEN1P49768 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
PSEN1P49768 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
PSEN1P49768 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
PSEN1P49768 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
PSEN1P49768 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.54■■■□□ 2
PSEN1P49768 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PSEN1P49768 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PSEN1P49768 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PSEN1P49768 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PSEN1P49768 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PSEN1P49768 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PSEN1P49768 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PSEN1P49768 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PSEN1P49768 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PSEN1P49768 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
PSEN1P49768 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PSEN1P49768 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PSEN1P49768 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PSEN1P49768 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PSEN1P49768 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PSEN1P49768 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
PSEN1P49768 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PSEN1P49768 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PSEN1P49768 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PSEN1P49768 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PSEN1P49768 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PSEN1P49768 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PSEN1P49768 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PSEN1P49768 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
PSEN1P49768 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
PSEN1P49768 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PSEN1P49768 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PSEN1P49768 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PSEN1P49768 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PSEN1P49768 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PSEN1P49768 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PSEN1P49768 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PSEN1P49768 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
PSEN1P49768 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PSEN1P49768 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PSEN1P49768 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PSEN1P49768 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PSEN1P49768 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PSEN1P49768 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PSEN1P49768 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PSEN1P49768 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PSEN1P49768 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PSEN1P49768 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
PSEN1P49768 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PSEN1P49768 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms