Protein–RNA interactions for Protein: P49721

PSMB2, Proteasome subunit beta type-2, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB2P49721 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PSMB2P49721 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PSMB2P49721 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PSMB2P49721 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PSMB2P49721 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PSMB2P49721 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PSMB2P49721 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
PSMB2P49721 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PSMB2P49721 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PSMB2P49721 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PSMB2P49721 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PSMB2P49721 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PSMB2P49721 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PSMB2P49721 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PSMB2P49721 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PSMB2P49721 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PSMB2P49721 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PSMB2P49721 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PSMB2P49721 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PSMB2P49721 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PSMB2P49721 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PSMB2P49721 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PSMB2P49721 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PSMB2P49721 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PSMB2P49721 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PSMB2P49721 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PSMB2P49721 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PSMB2P49721 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PSMB2P49721 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PSMB2P49721 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PSMB2P49721 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PSMB2P49721 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PSMB2P49721 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PSMB2P49721 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PSMB2P49721 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PSMB2P49721 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PSMB2P49721 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PSMB2P49721 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PSMB2P49721 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PSMB2P49721 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PSMB2P49721 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PSMB2P49721 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PSMB2P49721 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PSMB2P49721 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PSMB2P49721 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PSMB2P49721 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PSMB2P49721 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PSMB2P49721 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PSMB2P49721 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PSMB2P49721 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PSMB2P49721 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PSMB2P49721 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PSMB2P49721 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PSMB2P49721 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PSMB2P49721 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PSMB2P49721 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PSMB2P49721 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PSMB2P49721 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PSMB2P49721 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PSMB2P49721 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PSMB2P49721 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PSMB2P49721 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PSMB2P49721 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PSMB2P49721 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PSMB2P49721 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PSMB2P49721 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PSMB2P49721 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PSMB2P49721 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PSMB2P49721 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PSMB2P49721 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PSMB2P49721 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PSMB2P49721 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PSMB2P49721 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PSMB2P49721 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
PSMB2P49721 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PSMB2P49721 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PSMB2P49721 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PSMB2P49721 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PSMB2P49721 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PSMB2P49721 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PSMB2P49721 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PSMB2P49721 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PSMB2P49721 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PSMB2P49721 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PSMB2P49721 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PSMB2P49721 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PSMB2P49721 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PSMB2P49721 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PSMB2P49721 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PSMB2P49721 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
PSMB2P49721 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PSMB2P49721 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PSMB2P49721 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PSMB2P49721 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PSMB2P49721 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PSMB2P49721 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PSMB2P49721 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PSMB2P49721 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PSMB2P49721 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
PSMB2P49721 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms