Protein–RNA interactions for Protein: P49335

POU3F4, POU domain, class 3, transcription factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POU3F4P49335 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
POU3F4P49335 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
POU3F4P49335 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
POU3F4P49335 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
POU3F4P49335 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
POU3F4P49335 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
POU3F4P49335 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
POU3F4P49335 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
POU3F4P49335 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
POU3F4P49335 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
POU3F4P49335 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
POU3F4P49335 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
POU3F4P49335 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
POU3F4P49335 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
POU3F4P49335 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
POU3F4P49335 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
POU3F4P49335 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
POU3F4P49335 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
POU3F4P49335 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
POU3F4P49335 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
POU3F4P49335 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
POU3F4P49335 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
POU3F4P49335 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
POU3F4P49335 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
POU3F4P49335 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
POU3F4P49335 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
POU3F4P49335 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
POU3F4P49335 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
POU3F4P49335 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
POU3F4P49335 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
POU3F4P49335 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
POU3F4P49335 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
POU3F4P49335 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
POU3F4P49335 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
POU3F4P49335 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
POU3F4P49335 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
POU3F4P49335 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
POU3F4P49335 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
POU3F4P49335 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
POU3F4P49335 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
POU3F4P49335 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
POU3F4P49335 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
POU3F4P49335 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
POU3F4P49335 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
POU3F4P49335 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
POU3F4P49335 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
POU3F4P49335 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
POU3F4P49335 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
POU3F4P49335 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
POU3F4P49335 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
POU3F4P49335 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
POU3F4P49335 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
POU3F4P49335 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
POU3F4P49335 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
POU3F4P49335 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
POU3F4P49335 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
POU3F4P49335 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
POU3F4P49335 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
POU3F4P49335 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
POU3F4P49335 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
POU3F4P49335 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
POU3F4P49335 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
POU3F4P49335 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
POU3F4P49335 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
POU3F4P49335 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
POU3F4P49335 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
POU3F4P49335 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
POU3F4P49335 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
POU3F4P49335 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
POU3F4P49335 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
POU3F4P49335 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
POU3F4P49335 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
POU3F4P49335 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
POU3F4P49335 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
POU3F4P49335 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
POU3F4P49335 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
POU3F4P49335 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
POU3F4P49335 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
POU3F4P49335 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
POU3F4P49335 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
POU3F4P49335 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
POU3F4P49335 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
POU3F4P49335 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
POU3F4P49335 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
POU3F4P49335 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
POU3F4P49335 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
POU3F4P49335 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
POU3F4P49335 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
POU3F4P49335 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
POU3F4P49335 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
POU3F4P49335 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
POU3F4P49335 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
POU3F4P49335 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
POU3F4P49335 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
POU3F4P49335 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
POU3F4P49335 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
POU3F4P49335 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
POU3F4P49335 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
POU3F4P49335 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
POU3F4P49335 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms