Protein–RNA interactions for Protein: P48556

PSMD8, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD8P48556 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
PSMD8P48556 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
PSMD8P48556 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PSMD8P48556 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PSMD8P48556 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PSMD8P48556 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PSMD8P48556 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PSMD8P48556 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PSMD8P48556 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PSMD8P48556 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PSMD8P48556 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PSMD8P48556 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PSMD8P48556 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PSMD8P48556 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PSMD8P48556 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PSMD8P48556 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PSMD8P48556 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PSMD8P48556 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PSMD8P48556 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PSMD8P48556 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PSMD8P48556 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PSMD8P48556 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PSMD8P48556 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PSMD8P48556 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PSMD8P48556 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PSMD8P48556 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PSMD8P48556 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PSMD8P48556 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PSMD8P48556 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PSMD8P48556 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PSMD8P48556 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PSMD8P48556 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PSMD8P48556 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PSMD8P48556 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PSMD8P48556 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
PSMD8P48556 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
PSMD8P48556 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PSMD8P48556 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PSMD8P48556 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PSMD8P48556 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PSMD8P48556 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PSMD8P48556 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PSMD8P48556 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PSMD8P48556 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PSMD8P48556 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PSMD8P48556 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
PSMD8P48556 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PSMD8P48556 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PSMD8P48556 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PSMD8P48556 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PSMD8P48556 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PSMD8P48556 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PSMD8P48556 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PSMD8P48556 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PSMD8P48556 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PSMD8P48556 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PSMD8P48556 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
PSMD8P48556 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PSMD8P48556 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PSMD8P48556 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PSMD8P48556 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PSMD8P48556 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PSMD8P48556 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PSMD8P48556 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PSMD8P48556 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PSMD8P48556 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PSMD8P48556 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PSMD8P48556 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PSMD8P48556 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PSMD8P48556 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PSMD8P48556 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PSMD8P48556 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PSMD8P48556 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PSMD8P48556 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PSMD8P48556 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PSMD8P48556 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PSMD8P48556 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PSMD8P48556 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PSMD8P48556 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PSMD8P48556 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PSMD8P48556 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PSMD8P48556 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PSMD8P48556 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PSMD8P48556 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PSMD8P48556 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
PSMD8P48556 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PSMD8P48556 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PSMD8P48556 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PSMD8P48556 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PSMD8P48556 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PSMD8P48556 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
PSMD8P48556 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PSMD8P48556 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PSMD8P48556 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
PSMD8P48556 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PSMD8P48556 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PSMD8P48556 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
PSMD8P48556 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
PSMD8P48556 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
PSMD8P48556 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms