Protein–RNA interactions for Protein: P48443

RXRG, Retinoic acid receptor RXR-gamma, humanhuman

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RXRGP48443 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RXRGP48443 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
RXRGP48443 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
RXRGP48443 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RXRGP48443 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
RXRGP48443 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RXRGP48443 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RXRGP48443 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RXRGP48443 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RXRGP48443 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RXRGP48443 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
RXRGP48443 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.16■■□□□ 1.78
RXRGP48443 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
RXRGP48443 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RXRGP48443 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RXRGP48443 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
RXRGP48443 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
RXRGP48443 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
RXRGP48443 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
RXRGP48443 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RXRGP48443 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
RXRGP48443 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RXRGP48443 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RXRGP48443 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RXRGP48443 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RXRGP48443 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RXRGP48443 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RXRGP48443 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RXRGP48443 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
RXRGP48443 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RXRGP48443 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RXRGP48443 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RXRGP48443 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RXRGP48443 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RXRGP48443 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RXRGP48443 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RXRGP48443 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RXRGP48443 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RXRGP48443 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RXRGP48443 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RXRGP48443 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RXRGP48443 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
RXRGP48443 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
RXRGP48443 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RXRGP48443 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RXRGP48443 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RXRGP48443 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RXRGP48443 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RXRGP48443 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RXRGP48443 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RXRGP48443 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RXRGP48443 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RXRGP48443 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RXRGP48443 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RXRGP48443 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RXRGP48443 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RXRGP48443 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RXRGP48443 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RXRGP48443 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RXRGP48443 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RXRGP48443 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
RXRGP48443 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RXRGP48443 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RXRGP48443 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RXRGP48443 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RXRGP48443 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RXRGP48443 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RXRGP48443 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RXRGP48443 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RXRGP48443 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RXRGP48443 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RXRGP48443 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RXRGP48443 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RXRGP48443 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RXRGP48443 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
RXRGP48443 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
RXRGP48443 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RXRGP48443 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RXRGP48443 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RXRGP48443 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RXRGP48443 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RXRGP48443 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
RXRGP48443 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
RXRGP48443 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
RXRGP48443 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
RXRGP48443 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
RXRGP48443 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
RXRGP48443 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
RXRGP48443 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
RXRGP48443 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
RXRGP48443 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RXRGP48443 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RXRGP48443 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RXRGP48443 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RXRGP48443 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RXRGP48443 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RXRGP48443 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
RXRGP48443 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
RXRGP48443 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
RXRGP48443 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms