Protein–RNA interactions for Protein: P47888

OR3A3, Olfactory receptor 3A3, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OR3A3P47888 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
OR3A3P47888 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
OR3A3P47888 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
OR3A3P47888 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
OR3A3P47888 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
OR3A3P47888 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
OR3A3P47888 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
OR3A3P47888 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
OR3A3P47888 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
OR3A3P47888 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
OR3A3P47888 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
OR3A3P47888 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
OR3A3P47888 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
OR3A3P47888 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
OR3A3P47888 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
OR3A3P47888 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
OR3A3P47888 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
OR3A3P47888 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
OR3A3P47888 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
OR3A3P47888 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
OR3A3P47888 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
OR3A3P47888 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
OR3A3P47888 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
OR3A3P47888 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
OR3A3P47888 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
OR3A3P47888 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
OR3A3P47888 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
OR3A3P47888 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
OR3A3P47888 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
OR3A3P47888 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
OR3A3P47888 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
OR3A3P47888 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
OR3A3P47888 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
OR3A3P47888 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
OR3A3P47888 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
OR3A3P47888 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
OR3A3P47888 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
OR3A3P47888 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
OR3A3P47888 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
OR3A3P47888 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
OR3A3P47888 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
OR3A3P47888 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
OR3A3P47888 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
OR3A3P47888 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
OR3A3P47888 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
OR3A3P47888 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
OR3A3P47888 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
OR3A3P47888 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
OR3A3P47888 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
OR3A3P47888 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
OR3A3P47888 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
OR3A3P47888 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
OR3A3P47888 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
OR3A3P47888 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
OR3A3P47888 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
OR3A3P47888 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
OR3A3P47888 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
OR3A3P47888 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
OR3A3P47888 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
OR3A3P47888 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
OR3A3P47888 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
OR3A3P47888 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
OR3A3P47888 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
OR3A3P47888 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
OR3A3P47888 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
OR3A3P47888 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
OR3A3P47888 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
OR3A3P47888 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
OR3A3P47888 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
OR3A3P47888 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
OR3A3P47888 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
OR3A3P47888 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
OR3A3P47888 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
OR3A3P47888 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
OR3A3P47888 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
OR3A3P47888 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
OR3A3P47888 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
OR3A3P47888 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
OR3A3P47888 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
OR3A3P47888 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
OR3A3P47888 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
OR3A3P47888 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
OR3A3P47888 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
OR3A3P47888 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
OR3A3P47888 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
OR3A3P47888 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
OR3A3P47888 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
OR3A3P47888 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
OR3A3P47888 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
OR3A3P47888 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
OR3A3P47888 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
OR3A3P47888 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
OR3A3P47888 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
OR3A3P47888 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
OR3A3P47888 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
OR3A3P47888 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
OR3A3P47888 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
OR3A3P47888 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
OR3A3P47888 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
OR3A3P47888 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms