Protein–RNA interactions for Protein: P47870

GABRB2, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRB2P47870 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
GABRB2P47870 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
GABRB2P47870 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
GABRB2P47870 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
GABRB2P47870 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
GABRB2P47870 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
GABRB2P47870 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
GABRB2P47870 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
GABRB2P47870 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
GABRB2P47870 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
GABRB2P47870 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
GABRB2P47870 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
GABRB2P47870 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
GABRB2P47870 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
GABRB2P47870 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
GABRB2P47870 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
GABRB2P47870 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
GABRB2P47870 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
GABRB2P47870 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
GABRB2P47870 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
GABRB2P47870 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27.67■■■□□ 2.02
GABRB2P47870 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
GABRB2P47870 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
GABRB2P47870 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
GABRB2P47870 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
GABRB2P47870 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
GABRB2P47870 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
GABRB2P47870 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
GABRB2P47870 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
GABRB2P47870 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
GABRB2P47870 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
GABRB2P47870 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
GABRB2P47870 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
GABRB2P47870 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
GABRB2P47870 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
GABRB2P47870 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
GABRB2P47870 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
GABRB2P47870 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
GABRB2P47870 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
GABRB2P47870 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
GABRB2P47870 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
GABRB2P47870 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
GABRB2P47870 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
GABRB2P47870 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
GABRB2P47870 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
GABRB2P47870 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
GABRB2P47870 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
GABRB2P47870 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
GABRB2P47870 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
GABRB2P47870 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
GABRB2P47870 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
GABRB2P47870 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
GABRB2P47870 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
GABRB2P47870 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
GABRB2P47870 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
GABRB2P47870 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
GABRB2P47870 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
GABRB2P47870 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.56■■■□□ 2
GABRB2P47870 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
GABRB2P47870 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
GABRB2P47870 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
GABRB2P47870 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
GABRB2P47870 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
GABRB2P47870 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
GABRB2P47870 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
GABRB2P47870 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
GABRB2P47870 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
GABRB2P47870 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
GABRB2P47870 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
GABRB2P47870 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
GABRB2P47870 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
GABRB2P47870 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
GABRB2P47870 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
GABRB2P47870 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
GABRB2P47870 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
GABRB2P47870 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
GABRB2P47870 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
GABRB2P47870 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
GABRB2P47870 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
GABRB2P47870 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
GABRB2P47870 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
GABRB2P47870 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
GABRB2P47870 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
GABRB2P47870 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
GABRB2P47870 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
GABRB2P47870 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
GABRB2P47870 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
GABRB2P47870 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
GABRB2P47870 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
GABRB2P47870 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
GABRB2P47870 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
GABRB2P47870 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
GABRB2P47870 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
GABRB2P47870 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
GABRB2P47870 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
GABRB2P47870 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
GABRB2P47870 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
GABRB2P47870 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
GABRB2P47870 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
GABRB2P47870 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms