Protein–RNA interactions for Protein: P41440

SLC19A1, Folate transporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC19A1P41440 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC19A1P41440 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC19A1P41440 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC19A1P41440 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC19A1P41440 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC19A1P41440 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC19A1P41440 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC19A1P41440 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
SLC19A1P41440 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SLC19A1P41440 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SLC19A1P41440 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SLC19A1P41440 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SLC19A1P41440 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SLC19A1P41440 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLC19A1P41440 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLC19A1P41440 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLC19A1P41440 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLC19A1P41440 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC19A1P41440 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC19A1P41440 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC19A1P41440 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC19A1P41440 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC19A1P41440 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC19A1P41440 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC19A1P41440 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC19A1P41440 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC19A1P41440 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC19A1P41440 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC19A1P41440 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC19A1P41440 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SLC19A1P41440 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SLC19A1P41440 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SLC19A1P41440 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SLC19A1P41440 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SLC19A1P41440 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
SLC19A1P41440 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SLC19A1P41440 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
SLC19A1P41440 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLC19A1P41440 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SLC19A1P41440 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SLC19A1P41440 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
SLC19A1P41440 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SLC19A1P41440 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SLC19A1P41440 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLC19A1P41440 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SLC19A1P41440 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
SLC19A1P41440 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SLC19A1P41440 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SLC19A1P41440 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SLC19A1P41440 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SLC19A1P41440 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SLC19A1P41440 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SLC19A1P41440 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SLC19A1P41440 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SLC19A1P41440 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SLC19A1P41440 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SLC19A1P41440 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLC19A1P41440 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLC19A1P41440 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLC19A1P41440 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLC19A1P41440 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLC19A1P41440 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLC19A1P41440 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC19A1P41440 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC19A1P41440 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC19A1P41440 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC19A1P41440 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC19A1P41440 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC19A1P41440 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC19A1P41440 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC19A1P41440 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC19A1P41440 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLC19A1P41440 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC19A1P41440 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC19A1P41440 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC19A1P41440 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC19A1P41440 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC19A1P41440 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC19A1P41440 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC19A1P41440 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC19A1P41440 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC19A1P41440 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC19A1P41440 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC19A1P41440 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC19A1P41440 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC19A1P41440 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC19A1P41440 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC19A1P41440 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC19A1P41440 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC19A1P41440 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC19A1P41440 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
SLC19A1P41440 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLC19A1P41440 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLC19A1P41440 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC19A1P41440 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC19A1P41440 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC19A1P41440 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC19A1P41440 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC19A1P41440 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC19A1P41440 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.6 ms