Protein–RNA interactions for Protein: P41229

KDM5C, Lysine-specific demethylase 5C, humanhuman

Predictions only

Length 1,560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5CP41229 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC40.53■■■■■ 4.08
KDM5CP41229 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.52■■■■■ 4.08
KDM5CP41229 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.51■■■■■ 4.08
KDM5CP41229 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC40.51■■■■■ 4.08
KDM5CP41229 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.5■■■■■ 4.07
KDM5CP41229 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40.5■■■■■ 4.07
KDM5CP41229 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC40.49■■■■■ 4.07
KDM5CP41229 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.47■■■■■ 4.07
KDM5CP41229 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC40.47■■■■■ 4.07
KDM5CP41229 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.42■■■■■ 4.06
KDM5CP41229 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40.41■■■■■ 4.06
KDM5CP41229 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC40.4■■■■■ 4.06
KDM5CP41229 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.4■■■■■ 4.06
KDM5CP41229 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC40.4■■■■■ 4.06
KDM5CP41229 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC40.4■■■■■ 4.06
KDM5CP41229 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC40.4■■■■■ 4.06
KDM5CP41229 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC40.39■■■■■ 4.06
KDM5CP41229 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.38■■■■■ 4.06
KDM5CP41229 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.38■■■■■ 4.05
KDM5CP41229 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC40.38■■■■■ 4.05
KDM5CP41229 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC40.37■■■■■ 4.05
KDM5CP41229 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.35■■■■■ 4.05
KDM5CP41229 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC40.34■■■■■ 4.05
KDM5CP41229 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC40.33■■■■■ 4.05
KDM5CP41229 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC40.32■■■■■ 4.05
KDM5CP41229 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC40.32■■■■■ 4.05
KDM5CP41229 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC40.31■■■■■ 4.04
KDM5CP41229 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC40.31■■■■■ 4.04
KDM5CP41229 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC40.31■■■■■ 4.04
KDM5CP41229 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC40.31■■■■■ 4.04
KDM5CP41229 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC40.31■■■■■ 4.04
KDM5CP41229 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.31■■■■■ 4.04
KDM5CP41229 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.31■■■■■ 4.04
KDM5CP41229 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.31■■■■■ 4.04
KDM5CP41229 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC40.31■■■■■ 4.04
KDM5CP41229 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.31■■■■■ 4.04
KDM5CP41229 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC40.3■■■■■ 4.04
KDM5CP41229 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC40.27■■■■■ 4.04
KDM5CP41229 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC40.27■■■■■ 4.04
KDM5CP41229 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC40.24■■■■■ 4.03
KDM5CP41229 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC40.22■■■■■ 4.03
KDM5CP41229 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC40.21■■■■■ 4.03
KDM5CP41229 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.2■■■■■ 4.03
KDM5CP41229 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.18■■■■■ 4.02
KDM5CP41229 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.18■■■■■ 4.02
KDM5CP41229 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC40.17■■■■■ 4.02
KDM5CP41229 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.17■■■■■ 4.02
KDM5CP41229 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC40.16■■■■■ 4.02
KDM5CP41229 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.16■■■■■ 4.02
KDM5CP41229 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC40.16■■■■■ 4.02
KDM5CP41229 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC40.14■■■■■ 4.02
KDM5CP41229 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC40.14■■■■■ 4.02
KDM5CP41229 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.14■■■■■ 4.02
KDM5CP41229 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.13■■■■■ 4.02
KDM5CP41229 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC40.13■■■■■ 4.01
KDM5CP41229 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC40.13■■■■■ 4.01
KDM5CP41229 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.12■■■■■ 4.01
KDM5CP41229 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.11■■■■■ 4.01
KDM5CP41229 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC40.11■■■■■ 4.01
KDM5CP41229 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC40.1■■■■■ 4.01
KDM5CP41229 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC40.1■■■■■ 4.01
KDM5CP41229 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC40.08■■■■■ 4.01
KDM5CP41229 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC40.08■■■■■ 4.01
KDM5CP41229 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.07■■■■■ 4
KDM5CP41229 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.07■■■■■ 4
KDM5CP41229 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC40.06■■■■■ 4
KDM5CP41229 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC40.05■■■■■ 4
KDM5CP41229 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.04■■■■■ 4
KDM5CP41229 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC40.04■■■■■ 4
KDM5CP41229 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC40.04■■■■■ 4
KDM5CP41229 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC40.04■■■■■ 4
KDM5CP41229 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC40.04■■■■■ 4
KDM5CP41229 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.02■■■■■ 4
KDM5CP41229 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC40.01■■■■■ 4
KDM5CP41229 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.01■■■■■ 4
KDM5CP41229 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.01■■■■■ 4
KDM5CP41229 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC40.01■■■■□ 3.99
KDM5CP41229 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.01■■■■□ 3.99
KDM5CP41229 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40■■■■□ 3.99
KDM5CP41229 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC40■■■■□ 3.99
KDM5CP41229 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC39.98■■■■□ 3.99
KDM5CP41229 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.98■■■■□ 3.99
KDM5CP41229 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC39.97■■■■□ 3.99
KDM5CP41229 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC39.96■■■■□ 3.99
KDM5CP41229 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.95■■■■□ 3.99
KDM5CP41229 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC39.95■■■■□ 3.99
KDM5CP41229 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.94■■■■□ 3.98
KDM5CP41229 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC39.94■■■■□ 3.98
KDM5CP41229 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC39.93■■■■□ 3.98
KDM5CP41229 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC39.93■■■■□ 3.98
KDM5CP41229 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC39.93■■■■□ 3.98
KDM5CP41229 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC39.92■■■■□ 3.98
KDM5CP41229 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.9■■■■□ 3.98
KDM5CP41229 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC39.88■■■■□ 3.98
KDM5CP41229 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.88■■■■□ 3.97
KDM5CP41229 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC39.88■■■■□ 3.97
KDM5CP41229 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC39.88■■■■□ 3.97
KDM5CP41229 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.88■■■■□ 3.97
KDM5CP41229 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC39.87■■■■□ 3.97
KDM5CP41229 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC39.87■■■■□ 3.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms