Protein–RNA interactions for Protein: P41219

PRPH, Peripherin, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPHP41219 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
PRPHP41219 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
PRPHP41219 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
PRPHP41219 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
PRPHP41219 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
PRPHP41219 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
PRPHP41219 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
PRPHP41219 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
PRPHP41219 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC29.74■■■□□ 2.35
PRPHP41219 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
PRPHP41219 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
PRPHP41219 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
PRPHP41219 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
PRPHP41219 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
PRPHP41219 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
PRPHP41219 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
PRPHP41219 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
PRPHP41219 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
PRPHP41219 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
PRPHP41219 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
PRPHP41219 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
PRPHP41219 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC29.7■■■□□ 2.34
PRPHP41219 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
PRPHP41219 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
PRPHP41219 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
PRPHP41219 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
PRPHP41219 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
PRPHP41219 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
PRPHP41219 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
PRPHP41219 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
PRPHP41219 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC29.68■■■□□ 2.34
PRPHP41219 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
PRPHP41219 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
PRPHP41219 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
PRPHP41219 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
PRPHP41219 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
PRPHP41219 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
PRPHP41219 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
PRPHP41219 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
PRPHP41219 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
PRPHP41219 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
PRPHP41219 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC29.64■■■□□ 2.34
PRPHP41219 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
PRPHP41219 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
PRPHP41219 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
PRPHP41219 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
PRPHP41219 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
PRPHP41219 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
PRPHP41219 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
PRPHP41219 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
PRPHP41219 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
PRPHP41219 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
PRPHP41219 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
PRPHP41219 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
PRPHP41219 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
PRPHP41219 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
PRPHP41219 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
PRPHP41219 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
PRPHP41219 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
PRPHP41219 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
PRPHP41219 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
PRPHP41219 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
PRPHP41219 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
PRPHP41219 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
PRPHP41219 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
PRPHP41219 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
PRPHP41219 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
PRPHP41219 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
PRPHP41219 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
PRPHP41219 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
PRPHP41219 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
PRPHP41219 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
PRPHP41219 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
PRPHP41219 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
PRPHP41219 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
PRPHP41219 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
PRPHP41219 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
PRPHP41219 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
PRPHP41219 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
PRPHP41219 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
PRPHP41219 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
PRPHP41219 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
PRPHP41219 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
PRPHP41219 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
PRPHP41219 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
PRPHP41219 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
PRPHP41219 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
PRPHP41219 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
PRPHP41219 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
PRPHP41219 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
PRPHP41219 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
PRPHP41219 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
PRPHP41219 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
PRPHP41219 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
PRPHP41219 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
PRPHP41219 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
PRPHP41219 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
PRPHP41219 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
PRPHP41219 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
PRPHP41219 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms