Protein–RNA interactions for Protein: P40617

ARL4A, ADP-ribosylation factor-like protein 4A, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL4AP40617 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ARL4AP40617 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ARL4AP40617 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ARL4AP40617 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ARL4AP40617 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ARL4AP40617 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ARL4AP40617 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ARL4AP40617 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ARL4AP40617 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ARL4AP40617 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
ARL4AP40617 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
ARL4AP40617 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
ARL4AP40617 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ARL4AP40617 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.94
ARL4AP40617 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ARL4AP40617 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ARL4AP40617 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ARL4AP40617 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
ARL4AP40617 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ARL4AP40617 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ARL4AP40617 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ARL4AP40617 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ARL4AP40617 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ARL4AP40617 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ARL4AP40617 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ARL4AP40617 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ARL4AP40617 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ARL4AP40617 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ARL4AP40617 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ARL4AP40617 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ARL4AP40617 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ARL4AP40617 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
ARL4AP40617 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
ARL4AP40617 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ARL4AP40617 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ARL4AP40617 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ARL4AP40617 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ARL4AP40617 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ARL4AP40617 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ARL4AP40617 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ARL4AP40617 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ARL4AP40617 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ARL4AP40617 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ARL4AP40617 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ARL4AP40617 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ARL4AP40617 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ARL4AP40617 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ARL4AP40617 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ARL4AP40617 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ARL4AP40617 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ARL4AP40617 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ARL4AP40617 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ARL4AP40617 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ARL4AP40617 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ARL4AP40617 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
ARL4AP40617 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
ARL4AP40617 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ARL4AP40617 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ARL4AP40617 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ARL4AP40617 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ARL4AP40617 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ARL4AP40617 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
ARL4AP40617 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ARL4AP40617 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
ARL4AP40617 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ARL4AP40617 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ARL4AP40617 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ARL4AP40617 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ARL4AP40617 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ARL4AP40617 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ARL4AP40617 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ARL4AP40617 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ARL4AP40617 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ARL4AP40617 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ARL4AP40617 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ARL4AP40617 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ARL4AP40617 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ARL4AP40617 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ARL4AP40617 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ARL4AP40617 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ARL4AP40617 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ARL4AP40617 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ARL4AP40617 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
ARL4AP40617 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ARL4AP40617 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ARL4AP40617 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ARL4AP40617 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ARL4AP40617 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ARL4AP40617 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ARL4AP40617 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ARL4AP40617 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ARL4AP40617 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ARL4AP40617 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ARL4AP40617 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ARL4AP40617 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ARL4AP40617 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ARL4AP40617 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
ARL4AP40617 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
ARL4AP40617 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ARL4AP40617 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms