Protein–RNA interactions for Protein: P40429

RPL13A, 60S ribosomal protein L13a, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL13AP40429 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPL13AP40429 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPL13AP40429 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPL13AP40429 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPL13AP40429 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RPL13AP40429 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RPL13AP40429 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RPL13AP40429 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RPL13AP40429 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RPL13AP40429 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RPL13AP40429 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RPL13AP40429 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RPL13AP40429 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RPL13AP40429 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RPL13AP40429 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RPL13AP40429 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RPL13AP40429 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RPL13AP40429 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RPL13AP40429 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RPL13AP40429 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RPL13AP40429 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPL13AP40429 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPL13AP40429 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPL13AP40429 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPL13AP40429 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPL13AP40429 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPL13AP40429 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPL13AP40429 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPL13AP40429 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPL13AP40429 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPL13AP40429 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPL13AP40429 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPL13AP40429 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPL13AP40429 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPL13AP40429 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPL13AP40429 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPL13AP40429 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPL13AP40429 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPL13AP40429 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPL13AP40429 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPL13AP40429 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPL13AP40429 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RPL13AP40429 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RPL13AP40429 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RPL13AP40429 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RPL13AP40429 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RPL13AP40429 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RPL13AP40429 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RPL13AP40429 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RPL13AP40429 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RPL13AP40429 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
RPL13AP40429 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RPL13AP40429 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RPL13AP40429 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RPL13AP40429 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RPL13AP40429 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RPL13AP40429 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RPL13AP40429 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RPL13AP40429 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RPL13AP40429 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RPL13AP40429 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RPL13AP40429 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RPL13AP40429 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RPL13AP40429 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RPL13AP40429 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RPL13AP40429 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RPL13AP40429 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RPL13AP40429 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RPL13AP40429 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RPL13AP40429 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RPL13AP40429 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RPL13AP40429 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
RPL13AP40429 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RPL13AP40429 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RPL13AP40429 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RPL13AP40429 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RPL13AP40429 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RPL13AP40429 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RPL13AP40429 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RPL13AP40429 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RPL13AP40429 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RPL13AP40429 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RPL13AP40429 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RPL13AP40429 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RPL13AP40429 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RPL13AP40429 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RPL13AP40429 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RPL13AP40429 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
RPL13AP40429 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RPL13AP40429 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RPL13AP40429 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RPL13AP40429 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RPL13AP40429 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RPL13AP40429 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RPL13AP40429 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RPL13AP40429 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RPL13AP40429 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RPL13AP40429 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RPL13AP40429 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
RPL13AP40429 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms