Protein–RNA interactions for Protein: P40199

CEACAM6, Carcinoembryonic antigen-related cell adhesion molecule 6, humanhuman

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEACAM6P40199 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CEACAM6P40199 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CEACAM6P40199 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CEACAM6P40199 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CEACAM6P40199 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CEACAM6P40199 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CEACAM6P40199 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CEACAM6P40199 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CEACAM6P40199 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CEACAM6P40199 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CEACAM6P40199 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CEACAM6P40199 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CEACAM6P40199 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CEACAM6P40199 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CEACAM6P40199 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CEACAM6P40199 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CEACAM6P40199 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CEACAM6P40199 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CEACAM6P40199 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CEACAM6P40199 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CEACAM6P40199 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CEACAM6P40199 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CEACAM6P40199 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CEACAM6P40199 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CEACAM6P40199 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CEACAM6P40199 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CEACAM6P40199 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CEACAM6P40199 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CEACAM6P40199 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CEACAM6P40199 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CEACAM6P40199 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CEACAM6P40199 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CEACAM6P40199 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CEACAM6P40199 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CEACAM6P40199 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CEACAM6P40199 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CEACAM6P40199 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CEACAM6P40199 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CEACAM6P40199 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CEACAM6P40199 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CEACAM6P40199 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CEACAM6P40199 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CEACAM6P40199 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CEACAM6P40199 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CEACAM6P40199 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CEACAM6P40199 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CEACAM6P40199 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CEACAM6P40199 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CEACAM6P40199 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CEACAM6P40199 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CEACAM6P40199 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CEACAM6P40199 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CEACAM6P40199 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CEACAM6P40199 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CEACAM6P40199 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CEACAM6P40199 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CEACAM6P40199 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CEACAM6P40199 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CEACAM6P40199 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CEACAM6P40199 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CEACAM6P40199 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CEACAM6P40199 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CEACAM6P40199 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CEACAM6P40199 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CEACAM6P40199 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CEACAM6P40199 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CEACAM6P40199 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CEACAM6P40199 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CEACAM6P40199 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CEACAM6P40199 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CEACAM6P40199 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CEACAM6P40199 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CEACAM6P40199 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CEACAM6P40199 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CEACAM6P40199 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CEACAM6P40199 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CEACAM6P40199 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CEACAM6P40199 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CEACAM6P40199 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CEACAM6P40199 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CEACAM6P40199 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CEACAM6P40199 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CEACAM6P40199 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CEACAM6P40199 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CEACAM6P40199 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CEACAM6P40199 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CEACAM6P40199 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CEACAM6P40199 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CEACAM6P40199 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CEACAM6P40199 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CEACAM6P40199 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CEACAM6P40199 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CEACAM6P40199 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CEACAM6P40199 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CEACAM6P40199 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CEACAM6P40199 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CEACAM6P40199 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CEACAM6P40199 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CEACAM6P40199 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CEACAM6P40199 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms