Protein–RNA interactions for Protein: P36941

LTBR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBRP36941 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
LTBRP36941 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
LTBRP36941 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
LTBRP36941 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
LTBRP36941 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
LTBRP36941 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
LTBRP36941 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
LTBRP36941 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
LTBRP36941 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
LTBRP36941 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
LTBRP36941 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
LTBRP36941 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
LTBRP36941 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
LTBRP36941 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
LTBRP36941 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
LTBRP36941 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
LTBRP36941 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
LTBRP36941 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
LTBRP36941 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
LTBRP36941 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
LTBRP36941 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
LTBRP36941 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
LTBRP36941 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
LTBRP36941 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
LTBRP36941 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
LTBRP36941 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
LTBRP36941 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
LTBRP36941 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
LTBRP36941 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
LTBRP36941 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
LTBRP36941 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
LTBRP36941 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
LTBRP36941 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
LTBRP36941 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
LTBRP36941 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
LTBRP36941 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
LTBRP36941 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
LTBRP36941 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
LTBRP36941 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
LTBRP36941 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
LTBRP36941 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
LTBRP36941 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
LTBRP36941 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
LTBRP36941 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
LTBRP36941 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
LTBRP36941 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
LTBRP36941 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
LTBRP36941 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
LTBRP36941 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
LTBRP36941 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
LTBRP36941 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
LTBRP36941 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
LTBRP36941 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
LTBRP36941 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
LTBRP36941 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
LTBRP36941 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
LTBRP36941 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
LTBRP36941 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
LTBRP36941 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
LTBRP36941 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
LTBRP36941 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
LTBRP36941 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
LTBRP36941 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
LTBRP36941 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
LTBRP36941 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
LTBRP36941 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
LTBRP36941 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
LTBRP36941 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
LTBRP36941 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
LTBRP36941 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
LTBRP36941 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
LTBRP36941 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
LTBRP36941 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
LTBRP36941 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
LTBRP36941 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
LTBRP36941 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
LTBRP36941 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
LTBRP36941 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
LTBRP36941 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
LTBRP36941 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
LTBRP36941 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
LTBRP36941 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
LTBRP36941 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
LTBRP36941 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
LTBRP36941 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
LTBRP36941 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
LTBRP36941 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
LTBRP36941 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
LTBRP36941 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
LTBRP36941 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
LTBRP36941 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
LTBRP36941 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
LTBRP36941 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
LTBRP36941 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
LTBRP36941 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
LTBRP36941 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
LTBRP36941 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
LTBRP36941 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
LTBRP36941 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
LTBRP36941 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms