Protein–RNA interactions for Protein: P36897

TGFBR1, TGF-beta receptor type-1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGFBR1P36897 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
TGFBR1P36897 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TGFBR1P36897 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TGFBR1P36897 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TGFBR1P36897 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TGFBR1P36897 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TGFBR1P36897 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TGFBR1P36897 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TGFBR1P36897 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TGFBR1P36897 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TGFBR1P36897 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TGFBR1P36897 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TGFBR1P36897 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TGFBR1P36897 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
TGFBR1P36897 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TGFBR1P36897 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TGFBR1P36897 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TGFBR1P36897 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TGFBR1P36897 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TGFBR1P36897 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TGFBR1P36897 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TGFBR1P36897 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TGFBR1P36897 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TGFBR1P36897 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TGFBR1P36897 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TGFBR1P36897 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TGFBR1P36897 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TGFBR1P36897 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TGFBR1P36897 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TGFBR1P36897 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TGFBR1P36897 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TGFBR1P36897 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TGFBR1P36897 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TGFBR1P36897 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TGFBR1P36897 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TGFBR1P36897 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TGFBR1P36897 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TGFBR1P36897 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TGFBR1P36897 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TGFBR1P36897 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TGFBR1P36897 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TGFBR1P36897 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TGFBR1P36897 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TGFBR1P36897 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TGFBR1P36897 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TGFBR1P36897 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TGFBR1P36897 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TGFBR1P36897 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TGFBR1P36897 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TGFBR1P36897 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TGFBR1P36897 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TGFBR1P36897 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TGFBR1P36897 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TGFBR1P36897 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TGFBR1P36897 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TGFBR1P36897 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TGFBR1P36897 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TGFBR1P36897 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TGFBR1P36897 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TGFBR1P36897 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TGFBR1P36897 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TGFBR1P36897 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TGFBR1P36897 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TGFBR1P36897 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TGFBR1P36897 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TGFBR1P36897 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TGFBR1P36897 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TGFBR1P36897 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TGFBR1P36897 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TGFBR1P36897 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TGFBR1P36897 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TGFBR1P36897 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
TGFBR1P36897 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TGFBR1P36897 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TGFBR1P36897 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TGFBR1P36897 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TGFBR1P36897 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TGFBR1P36897 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TGFBR1P36897 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TGFBR1P36897 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TGFBR1P36897 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TGFBR1P36897 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TGFBR1P36897 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TGFBR1P36897 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TGFBR1P36897 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TGFBR1P36897 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TGFBR1P36897 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TGFBR1P36897 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TGFBR1P36897 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TGFBR1P36897 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TGFBR1P36897 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TGFBR1P36897 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TGFBR1P36897 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TGFBR1P36897 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TGFBR1P36897 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TGFBR1P36897 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TGFBR1P36897 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TGFBR1P36897 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TGFBR1P36897 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TGFBR1P36897 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.9 ms