Protein–RNA interactions for Protein: P35520

CBS, Cystathionine beta-synthase, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBSP35520 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CBSP35520 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CBSP35520 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CBSP35520 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CBSP35520 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CBSP35520 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CBSP35520 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
CBSP35520 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
CBSP35520 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
CBSP35520 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CBSP35520 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CBSP35520 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CBSP35520 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CBSP35520 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CBSP35520 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CBSP35520 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CBSP35520 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CBSP35520 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CBSP35520 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CBSP35520 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CBSP35520 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CBSP35520 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
CBSP35520 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CBSP35520 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CBSP35520 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CBSP35520 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CBSP35520 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CBSP35520 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CBSP35520 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CBSP35520 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CBSP35520 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CBSP35520 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
CBSP35520 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CBSP35520 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CBSP35520 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CBSP35520 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CBSP35520 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CBSP35520 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CBSP35520 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CBSP35520 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CBSP35520 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CBSP35520 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CBSP35520 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
CBSP35520 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CBSP35520 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CBSP35520 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CBSP35520 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CBSP35520 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
CBSP35520 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CBSP35520 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CBSP35520 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CBSP35520 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CBSP35520 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CBSP35520 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CBSP35520 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CBSP35520 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CBSP35520 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CBSP35520 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CBSP35520 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CBSP35520 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CBSP35520 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CBSP35520 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CBSP35520 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CBSP35520 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CBSP35520 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CBSP35520 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CBSP35520 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CBSP35520 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CBSP35520 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CBSP35520 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CBSP35520 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CBSP35520 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CBSP35520 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CBSP35520 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CBSP35520 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
CBSP35520 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CBSP35520 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CBSP35520 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CBSP35520 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CBSP35520 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CBSP35520 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CBSP35520 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CBSP35520 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CBSP35520 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CBSP35520 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CBSP35520 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CBSP35520 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CBSP35520 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.58■■□□□ 1.68
CBSP35520 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CBSP35520 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CBSP35520 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CBSP35520 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CBSP35520 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CBSP35520 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CBSP35520 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CBSP35520 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CBSP35520 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CBSP35520 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CBSP35520 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CBSP35520 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms