Protein–RNA interactions for Protein: P31271

HOXA13, Homeobox protein Hox-A13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA13P31271 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
HOXA13P31271 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
HOXA13P31271 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
HOXA13P31271 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
HOXA13P31271 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC30.24■■■□□ 2.43
HOXA13P31271 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
HOXA13P31271 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
HOXA13P31271 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
HOXA13P31271 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
HOXA13P31271 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
HOXA13P31271 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
HOXA13P31271 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
HOXA13P31271 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.19■■■□□ 2.42
HOXA13P31271 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
HOXA13P31271 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
HOXA13P31271 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC30.18■■■□□ 2.42
HOXA13P31271 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
HOXA13P31271 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
HOXA13P31271 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
HOXA13P31271 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
HOXA13P31271 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC30.15■■■□□ 2.42
HOXA13P31271 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
HOXA13P31271 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
HOXA13P31271 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC30.14■■■□□ 2.42
HOXA13P31271 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
HOXA13P31271 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
HOXA13P31271 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
HOXA13P31271 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC30.11■■■□□ 2.41
HOXA13P31271 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
HOXA13P31271 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
HOXA13P31271 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
HOXA13P31271 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
HOXA13P31271 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
HOXA13P31271 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
HOXA13P31271 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
HOXA13P31271 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
HOXA13P31271 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC30.08■■■□□ 2.41
HOXA13P31271 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC30.08■■■□□ 2.41
HOXA13P31271 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
HOXA13P31271 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
HOXA13P31271 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
HOXA13P31271 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
HOXA13P31271 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
HOXA13P31271 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
HOXA13P31271 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
HOXA13P31271 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
HOXA13P31271 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
HOXA13P31271 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
HOXA13P31271 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
HOXA13P31271 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
HOXA13P31271 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
HOXA13P31271 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
HOXA13P31271 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
HOXA13P31271 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
HOXA13P31271 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
HOXA13P31271 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
HOXA13P31271 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
HOXA13P31271 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC29.97■■■□□ 2.39
HOXA13P31271 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
HOXA13P31271 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
HOXA13P31271 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
HOXA13P31271 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
HOXA13P31271 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
HOXA13P31271 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
HOXA13P31271 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
HOXA13P31271 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
HOXA13P31271 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
HOXA13P31271 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
HOXA13P31271 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
HOXA13P31271 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
HOXA13P31271 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
HOXA13P31271 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
HOXA13P31271 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
HOXA13P31271 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC29.89■■■□□ 2.38
HOXA13P31271 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
HOXA13P31271 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
HOXA13P31271 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
HOXA13P31271 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
HOXA13P31271 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
HOXA13P31271 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
HOXA13P31271 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
HOXA13P31271 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
HOXA13P31271 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC29.87■■■□□ 2.37
HOXA13P31271 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
HOXA13P31271 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
HOXA13P31271 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
HOXA13P31271 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
HOXA13P31271 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
HOXA13P31271 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
HOXA13P31271 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
HOXA13P31271 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
HOXA13P31271 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
HOXA13P31271 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC29.84■■■□□ 2.37
HOXA13P31271 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
HOXA13P31271 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
HOXA13P31271 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
HOXA13P31271 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC29.83■■■□□ 2.37
HOXA13P31271 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
HOXA13P31271 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
HOXA13P31271 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.8 ms