Protein–RNA interactions for Protein: P29373

CRABP2, Cellular retinoic acid-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRABP2P29373 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
CRABP2P29373 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CRABP2P29373 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CRABP2P29373 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CRABP2P29373 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CRABP2P29373 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CRABP2P29373 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CRABP2P29373 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CRABP2P29373 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CRABP2P29373 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CRABP2P29373 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CRABP2P29373 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
CRABP2P29373 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
CRABP2P29373 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CRABP2P29373 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CRABP2P29373 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CRABP2P29373 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CRABP2P29373 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CRABP2P29373 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CRABP2P29373 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CRABP2P29373 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CRABP2P29373 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CRABP2P29373 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CRABP2P29373 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CRABP2P29373 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CRABP2P29373 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CRABP2P29373 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CRABP2P29373 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CRABP2P29373 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CRABP2P29373 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CRABP2P29373 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CRABP2P29373 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CRABP2P29373 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CRABP2P29373 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CRABP2P29373 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CRABP2P29373 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CRABP2P29373 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CRABP2P29373 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CRABP2P29373 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CRABP2P29373 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CRABP2P29373 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
CRABP2P29373 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CRABP2P29373 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CRABP2P29373 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CRABP2P29373 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CRABP2P29373 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CRABP2P29373 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CRABP2P29373 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CRABP2P29373 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CRABP2P29373 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CRABP2P29373 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CRABP2P29373 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CRABP2P29373 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CRABP2P29373 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CRABP2P29373 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CRABP2P29373 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CRABP2P29373 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CRABP2P29373 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CRABP2P29373 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CRABP2P29373 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CRABP2P29373 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CRABP2P29373 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CRABP2P29373 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CRABP2P29373 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CRABP2P29373 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CRABP2P29373 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CRABP2P29373 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
CRABP2P29373 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CRABP2P29373 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CRABP2P29373 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CRABP2P29373 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CRABP2P29373 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CRABP2P29373 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CRABP2P29373 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CRABP2P29373 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CRABP2P29373 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CRABP2P29373 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CRABP2P29373 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
CRABP2P29373 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CRABP2P29373 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CRABP2P29373 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CRABP2P29373 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CRABP2P29373 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CRABP2P29373 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CRABP2P29373 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CRABP2P29373 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CRABP2P29373 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CRABP2P29373 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CRABP2P29373 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
CRABP2P29373 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
CRABP2P29373 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CRABP2P29373 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CRABP2P29373 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CRABP2P29373 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CRABP2P29373 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CRABP2P29373 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CRABP2P29373 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
CRABP2P29373 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CRABP2P29373 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CRABP2P29373 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms