Protein–RNA interactions for Protein: P29122

PCSK6, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 6, humanhuman

Predictions only

Length 969 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCSK6P29122 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PCSK6P29122 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PCSK6P29122 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PCSK6P29122 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PCSK6P29122 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PCSK6P29122 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PCSK6P29122 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PCSK6P29122 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PCSK6P29122 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PCSK6P29122 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PCSK6P29122 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PCSK6P29122 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PCSK6P29122 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PCSK6P29122 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PCSK6P29122 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PCSK6P29122 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PCSK6P29122 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PCSK6P29122 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PCSK6P29122 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PCSK6P29122 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
PCSK6P29122 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PCSK6P29122 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PCSK6P29122 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
PCSK6P29122 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PCSK6P29122 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PCSK6P29122 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PCSK6P29122 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PCSK6P29122 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PCSK6P29122 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PCSK6P29122 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
PCSK6P29122 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PCSK6P29122 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PCSK6P29122 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PCSK6P29122 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PCSK6P29122 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PCSK6P29122 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PCSK6P29122 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PCSK6P29122 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PCSK6P29122 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PCSK6P29122 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PCSK6P29122 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PCSK6P29122 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PCSK6P29122 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PCSK6P29122 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PCSK6P29122 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PCSK6P29122 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PCSK6P29122 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PCSK6P29122 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PCSK6P29122 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PCSK6P29122 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PCSK6P29122 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PCSK6P29122 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PCSK6P29122 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PCSK6P29122 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PCSK6P29122 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PCSK6P29122 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PCSK6P29122 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PCSK6P29122 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PCSK6P29122 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PCSK6P29122 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PCSK6P29122 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PCSK6P29122 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PCSK6P29122 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PCSK6P29122 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PCSK6P29122 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PCSK6P29122 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PCSK6P29122 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PCSK6P29122 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PCSK6P29122 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PCSK6P29122 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PCSK6P29122 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PCSK6P29122 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PCSK6P29122 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PCSK6P29122 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PCSK6P29122 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PCSK6P29122 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PCSK6P29122 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PCSK6P29122 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PCSK6P29122 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PCSK6P29122 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PCSK6P29122 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PCSK6P29122 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PCSK6P29122 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PCSK6P29122 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PCSK6P29122 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
PCSK6P29122 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PCSK6P29122 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PCSK6P29122 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
PCSK6P29122 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PCSK6P29122 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PCSK6P29122 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PCSK6P29122 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PCSK6P29122 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PCSK6P29122 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
PCSK6P29122 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PCSK6P29122 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PCSK6P29122 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PCSK6P29122 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PCSK6P29122 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PCSK6P29122 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms