Protein–RNA interactions for Protein: P28328

PEX2, Peroxisome biogenesis factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX2P28328 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PEX2P28328 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
PEX2P28328 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PEX2P28328 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
PEX2P28328 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PEX2P28328 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PEX2P28328 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PEX2P28328 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PEX2P28328 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PEX2P28328 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PEX2P28328 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PEX2P28328 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PEX2P28328 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PEX2P28328 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PEX2P28328 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PEX2P28328 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PEX2P28328 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PEX2P28328 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PEX2P28328 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PEX2P28328 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PEX2P28328 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PEX2P28328 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PEX2P28328 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PEX2P28328 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PEX2P28328 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PEX2P28328 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PEX2P28328 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PEX2P28328 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PEX2P28328 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PEX2P28328 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PEX2P28328 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PEX2P28328 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PEX2P28328 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PEX2P28328 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PEX2P28328 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PEX2P28328 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PEX2P28328 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PEX2P28328 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PEX2P28328 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PEX2P28328 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PEX2P28328 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PEX2P28328 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PEX2P28328 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PEX2P28328 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PEX2P28328 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PEX2P28328 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PEX2P28328 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PEX2P28328 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PEX2P28328 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PEX2P28328 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PEX2P28328 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PEX2P28328 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PEX2P28328 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PEX2P28328 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PEX2P28328 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PEX2P28328 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PEX2P28328 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PEX2P28328 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PEX2P28328 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PEX2P28328 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PEX2P28328 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PEX2P28328 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PEX2P28328 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PEX2P28328 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PEX2P28328 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PEX2P28328 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PEX2P28328 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PEX2P28328 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PEX2P28328 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PEX2P28328 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PEX2P28328 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PEX2P28328 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PEX2P28328 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PEX2P28328 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PEX2P28328 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PEX2P28328 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
PEX2P28328 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PEX2P28328 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PEX2P28328 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PEX2P28328 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PEX2P28328 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PEX2P28328 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PEX2P28328 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PEX2P28328 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
PEX2P28328 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PEX2P28328 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PEX2P28328 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PEX2P28328 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PEX2P28328 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PEX2P28328 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PEX2P28328 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PEX2P28328 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PEX2P28328 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PEX2P28328 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PEX2P28328 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PEX2P28328 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PEX2P28328 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PEX2P28328 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PEX2P28328 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PEX2P28328 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.3 ms