Protein–RNA interactions for Protein: P27824

CANX, Calnexin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 592 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CANXP27824 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC34.6■■■■□ 3.13
CANXP27824 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
CANXP27824 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC34.58■■■■□ 3.13
CANXP27824 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC34.57■■■■□ 3.12
CANXP27824 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
CANXP27824 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.56■■■■□ 3.12
CANXP27824 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
CANXP27824 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC34.56■■■■□ 3.12
CANXP27824 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC34.56■■■■□ 3.12
CANXP27824 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
CANXP27824 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
CANXP27824 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.55■■■■□ 3.12
CANXP27824 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC34.54■■■■□ 3.12
CANXP27824 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
CANXP27824 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC34.54■■■■□ 3.12
CANXP27824 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC34.54■■■■□ 3.12
CANXP27824 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC34.54■■■■□ 3.12
CANXP27824 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
CANXP27824 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
CANXP27824 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
CANXP27824 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC34.53■■■■□ 3.12
CANXP27824 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
CANXP27824 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
CANXP27824 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC34.52■■■■□ 3.12
CANXP27824 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.52■■■■□ 3.12
CANXP27824 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
CANXP27824 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
CANXP27824 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC34.5■■■■□ 3.11
CANXP27824 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC34.5■■■■□ 3.11
CANXP27824 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
CANXP27824 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.49■■■■□ 3.11
CANXP27824 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
CANXP27824 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
CANXP27824 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.46■■■■□ 3.11
CANXP27824 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.1
CANXP27824 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC34.44■■■■□ 3.1
CANXP27824 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
CANXP27824 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
CANXP27824 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
CANXP27824 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
CANXP27824 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC34.4■■■■□ 3.1
CANXP27824 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
CANXP27824 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
CANXP27824 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
CANXP27824 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
CANXP27824 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
CANXP27824 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
CANXP27824 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC34.38■■■■□ 3.09
CANXP27824 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
CANXP27824 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
CANXP27824 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
CANXP27824 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC34.37■■■■□ 3.09
CANXP27824 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC34.36■■■■□ 3.09
CANXP27824 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
CANXP27824 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
CANXP27824 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.36■■■■□ 3.09
CANXP27824 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC34.35■■■■□ 3.09
CANXP27824 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC34.35■■■■□ 3.09
CANXP27824 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.35■■■■□ 3.09
CANXP27824 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC34.34■■■■□ 3.09
CANXP27824 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
CANXP27824 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.34■■■■□ 3.09
CANXP27824 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC34.33■■■■□ 3.09
CANXP27824 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
CANXP27824 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC34.33■■■■□ 3.09
CANXP27824 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
CANXP27824 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.32■■■■□ 3.08
CANXP27824 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
CANXP27824 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
CANXP27824 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
CANXP27824 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.31■■■■□ 3.08
CANXP27824 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
CANXP27824 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC34.29■■■■□ 3.08
CANXP27824 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC34.29■■■■□ 3.08
CANXP27824 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
CANXP27824 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
CANXP27824 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC34.28■■■■□ 3.08
CANXP27824 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
CANXP27824 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
CANXP27824 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC34.27■■■■□ 3.08
CANXP27824 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC34.27■■■■□ 3.08
CANXP27824 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
CANXP27824 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
CANXP27824 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC34.23■■■■□ 3.07
CANXP27824 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
CANXP27824 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC34.23■■■■□ 3.07
CANXP27824 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC34.23■■■■□ 3.07
CANXP27824 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC34.23■■■■□ 3.07
CANXP27824 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
CANXP27824 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
CANXP27824 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC34.22■■■■□ 3.07
CANXP27824 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
CANXP27824 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
CANXP27824 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
CANXP27824 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
CANXP27824 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
CANXP27824 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
CANXP27824 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
CANXP27824 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.06
CANXP27824 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms