Protein–RNA interactions for Protein: P26232

CTNNA2, Catenin alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA2P26232 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CTNNA2P26232 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CTNNA2P26232 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CTNNA2P26232 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CTNNA2P26232 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
CTNNA2P26232 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CTNNA2P26232 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CTNNA2P26232 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
CTNNA2P26232 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.55■■■□□ 2
CTNNA2P26232 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CTNNA2P26232 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC27.55■■■□□ 2
CTNNA2P26232 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CTNNA2P26232 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
CTNNA2P26232 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CTNNA2P26232 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CTNNA2P26232 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CTNNA2P26232 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CTNNA2P26232 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CTNNA2P26232 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CTNNA2P26232 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CTNNA2P26232 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CTNNA2P26232 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.51■■■□□ 2
CTNNA2P26232 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CTNNA2P26232 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
CTNNA2P26232 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CTNNA2P26232 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CTNNA2P26232 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CTNNA2P26232 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CTNNA2P26232 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CTNNA2P26232 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CTNNA2P26232 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CTNNA2P26232 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CTNNA2P26232 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
CTNNA2P26232 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CTNNA2P26232 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CTNNA2P26232 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CTNNA2P26232 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
CTNNA2P26232 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
CTNNA2P26232 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CTNNA2P26232 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CTNNA2P26232 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
CTNNA2P26232 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CTNNA2P26232 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CTNNA2P26232 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CTNNA2P26232 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CTNNA2P26232 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CTNNA2P26232 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CTNNA2P26232 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CTNNA2P26232 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CTNNA2P26232 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CTNNA2P26232 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CTNNA2P26232 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CTNNA2P26232 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CTNNA2P26232 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CTNNA2P26232 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CTNNA2P26232 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CTNNA2P26232 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CTNNA2P26232 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CTNNA2P26232 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CTNNA2P26232 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CTNNA2P26232 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CTNNA2P26232 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CTNNA2P26232 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CTNNA2P26232 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CTNNA2P26232 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CTNNA2P26232 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CTNNA2P26232 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CTNNA2P26232 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CTNNA2P26232 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CTNNA2P26232 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CTNNA2P26232 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CTNNA2P26232 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CTNNA2P26232 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CTNNA2P26232 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
CTNNA2P26232 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CTNNA2P26232 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CTNNA2P26232 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CTNNA2P26232 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CTNNA2P26232 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CTNNA2P26232 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CTNNA2P26232 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CTNNA2P26232 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CTNNA2P26232 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CTNNA2P26232 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CTNNA2P26232 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CTNNA2P26232 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CTNNA2P26232 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CTNNA2P26232 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CTNNA2P26232 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CTNNA2P26232 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
CTNNA2P26232 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CTNNA2P26232 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CTNNA2P26232 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
CTNNA2P26232 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CTNNA2P26232 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CTNNA2P26232 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CTNNA2P26232 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CTNNA2P26232 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CTNNA2P26232 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CTNNA2P26232 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms