Protein–RNA interactions for Protein: P23497

SP100, Nuclear autoantigen Sp-100, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 879 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP100P23497 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SP100P23497 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SP100P23497 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SP100P23497 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SP100P23497 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SP100P23497 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SP100P23497 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SP100P23497 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SP100P23497 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SP100P23497 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SP100P23497 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SP100P23497 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SP100P23497 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SP100P23497 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SP100P23497 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SP100P23497 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SP100P23497 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SP100P23497 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SP100P23497 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SP100P23497 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SP100P23497 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SP100P23497 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SP100P23497 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SP100P23497 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SP100P23497 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SP100P23497 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SP100P23497 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SP100P23497 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SP100P23497 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SP100P23497 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SP100P23497 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SP100P23497 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SP100P23497 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SP100P23497 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SP100P23497 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SP100P23497 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SP100P23497 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SP100P23497 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SP100P23497 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SP100P23497 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SP100P23497 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
SP100P23497 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SP100P23497 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
SP100P23497 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
SP100P23497 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
SP100P23497 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
SP100P23497 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
SP100P23497 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
SP100P23497 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
SP100P23497 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
SP100P23497 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SP100P23497 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SP100P23497 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SP100P23497 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SP100P23497 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SP100P23497 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SP100P23497 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SP100P23497 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SP100P23497 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SP100P23497 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SP100P23497 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SP100P23497 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SP100P23497 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SP100P23497 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SP100P23497 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SP100P23497 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
SP100P23497 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SP100P23497 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SP100P23497 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SP100P23497 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SP100P23497 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SP100P23497 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SP100P23497 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SP100P23497 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SP100P23497 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SP100P23497 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SP100P23497 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SP100P23497 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SP100P23497 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SP100P23497 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SP100P23497 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SP100P23497 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SP100P23497 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SP100P23497 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SP100P23497 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SP100P23497 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SP100P23497 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SP100P23497 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SP100P23497 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SP100P23497 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SP100P23497 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SP100P23497 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SP100P23497 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SP100P23497 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SP100P23497 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SP100P23497 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SP100P23497 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
SP100P23497 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SP100P23497 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SP100P23497 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms