Protein–RNA interactions for Protein: P21796

VDAC1, Voltage-dependent anion-selective channel protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VDAC1P21796 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
VDAC1P21796 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
VDAC1P21796 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
VDAC1P21796 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
VDAC1P21796 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
VDAC1P21796 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
VDAC1P21796 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
VDAC1P21796 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
VDAC1P21796 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
VDAC1P21796 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
VDAC1P21796 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
VDAC1P21796 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
VDAC1P21796 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
VDAC1P21796 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
VDAC1P21796 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
VDAC1P21796 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
VDAC1P21796 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
VDAC1P21796 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
VDAC1P21796 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
VDAC1P21796 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
VDAC1P21796 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
VDAC1P21796 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
VDAC1P21796 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
VDAC1P21796 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
VDAC1P21796 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
VDAC1P21796 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
VDAC1P21796 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
VDAC1P21796 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
VDAC1P21796 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
VDAC1P21796 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
VDAC1P21796 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
VDAC1P21796 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
VDAC1P21796 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
VDAC1P21796 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
VDAC1P21796 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
VDAC1P21796 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
VDAC1P21796 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
VDAC1P21796 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
VDAC1P21796 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
VDAC1P21796 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
VDAC1P21796 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
VDAC1P21796 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
VDAC1P21796 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
VDAC1P21796 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
VDAC1P21796 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
VDAC1P21796 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
VDAC1P21796 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
VDAC1P21796 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
VDAC1P21796 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
VDAC1P21796 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
VDAC1P21796 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
VDAC1P21796 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
VDAC1P21796 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
VDAC1P21796 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
VDAC1P21796 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
VDAC1P21796 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
VDAC1P21796 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
VDAC1P21796 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VDAC1P21796 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VDAC1P21796 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
VDAC1P21796 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
VDAC1P21796 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
VDAC1P21796 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
VDAC1P21796 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
VDAC1P21796 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VDAC1P21796 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VDAC1P21796 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VDAC1P21796 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
VDAC1P21796 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
VDAC1P21796 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
VDAC1P21796 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VDAC1P21796 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
VDAC1P21796 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
VDAC1P21796 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
VDAC1P21796 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
VDAC1P21796 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
VDAC1P21796 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
VDAC1P21796 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
VDAC1P21796 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
VDAC1P21796 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
VDAC1P21796 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
VDAC1P21796 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
VDAC1P21796 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
VDAC1P21796 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
VDAC1P21796 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VDAC1P21796 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VDAC1P21796 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
VDAC1P21796 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
VDAC1P21796 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
VDAC1P21796 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VDAC1P21796 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VDAC1P21796 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VDAC1P21796 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VDAC1P21796 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VDAC1P21796 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
VDAC1P21796 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
VDAC1P21796 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
VDAC1P21796 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
VDAC1P21796 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
VDAC1P21796 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms