Protein–RNA interactions for Protein: P21741

MDK, Midkine, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDKP21741 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MDKP21741 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MDKP21741 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MDKP21741 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MDKP21741 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MDKP21741 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MDKP21741 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MDKP21741 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
MDKP21741 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MDKP21741 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MDKP21741 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MDKP21741 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
MDKP21741 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MDKP21741 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MDKP21741 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MDKP21741 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MDKP21741 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MDKP21741 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MDKP21741 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MDKP21741 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MDKP21741 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MDKP21741 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MDKP21741 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MDKP21741 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MDKP21741 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MDKP21741 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MDKP21741 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MDKP21741 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MDKP21741 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MDKP21741 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MDKP21741 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MDKP21741 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MDKP21741 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MDKP21741 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MDKP21741 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MDKP21741 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MDKP21741 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MDKP21741 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MDKP21741 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MDKP21741 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MDKP21741 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MDKP21741 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MDKP21741 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MDKP21741 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MDKP21741 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MDKP21741 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MDKP21741 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MDKP21741 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MDKP21741 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MDKP21741 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MDKP21741 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MDKP21741 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MDKP21741 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MDKP21741 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MDKP21741 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MDKP21741 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MDKP21741 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MDKP21741 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MDKP21741 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MDKP21741 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MDKP21741 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MDKP21741 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MDKP21741 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MDKP21741 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MDKP21741 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MDKP21741 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MDKP21741 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MDKP21741 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
MDKP21741 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MDKP21741 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MDKP21741 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
MDKP21741 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MDKP21741 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MDKP21741 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MDKP21741 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MDKP21741 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MDKP21741 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MDKP21741 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MDKP21741 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
MDKP21741 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
MDKP21741 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MDKP21741 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MDKP21741 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MDKP21741 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MDKP21741 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MDKP21741 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MDKP21741 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MDKP21741 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MDKP21741 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MDKP21741 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MDKP21741 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MDKP21741 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MDKP21741 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MDKP21741 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MDKP21741 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MDKP21741 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MDKP21741 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MDKP21741 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MDKP21741 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MDKP21741 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms