Protein–RNA interactions for Protein: P18085

ARF4, ADP-ribosylation factor 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARF4P18085 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
ARF4P18085 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
ARF4P18085 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
ARF4P18085 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
ARF4P18085 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
ARF4P18085 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC28.87■■■□□ 2.21
ARF4P18085 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.86■■■□□ 2.21
ARF4P18085 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
ARF4P18085 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
ARF4P18085 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
ARF4P18085 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
ARF4P18085 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
ARF4P18085 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
ARF4P18085 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
ARF4P18085 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
ARF4P18085 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
ARF4P18085 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
ARF4P18085 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
ARF4P18085 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
ARF4P18085 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
ARF4P18085 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
ARF4P18085 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
ARF4P18085 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
ARF4P18085 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC28.78■■■□□ 2.2
ARF4P18085 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
ARF4P18085 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
ARF4P18085 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC28.77■■■□□ 2.2
ARF4P18085 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
ARF4P18085 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
ARF4P18085 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
ARF4P18085 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
ARF4P18085 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
ARF4P18085 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
ARF4P18085 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
ARF4P18085 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
ARF4P18085 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
ARF4P18085 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
ARF4P18085 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
ARF4P18085 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
ARF4P18085 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
ARF4P18085 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
ARF4P18085 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
ARF4P18085 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ARF4P18085 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
ARF4P18085 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
ARF4P18085 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
ARF4P18085 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
ARF4P18085 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC28.67■■■□□ 2.18
ARF4P18085 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
ARF4P18085 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
ARF4P18085 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
ARF4P18085 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
ARF4P18085 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
ARF4P18085 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
ARF4P18085 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
ARF4P18085 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
ARF4P18085 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
ARF4P18085 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
ARF4P18085 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
ARF4P18085 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
ARF4P18085 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
ARF4P18085 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
ARF4P18085 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
ARF4P18085 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
ARF4P18085 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
ARF4P18085 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
ARF4P18085 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
ARF4P18085 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
ARF4P18085 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
ARF4P18085 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
ARF4P18085 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
ARF4P18085 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
ARF4P18085 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
ARF4P18085 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
ARF4P18085 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
ARF4P18085 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ARF4P18085 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
ARF4P18085 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ARF4P18085 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
ARF4P18085 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ARF4P18085 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ARF4P18085 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ARF4P18085 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC28.54■■■□□ 2.16
ARF4P18085 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ARF4P18085 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
ARF4P18085 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
ARF4P18085 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
ARF4P18085 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.15
ARF4P18085 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
ARF4P18085 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
ARF4P18085 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ARF4P18085 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
ARF4P18085 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
ARF4P18085 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
ARF4P18085 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
ARF4P18085 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
ARF4P18085 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ARF4P18085 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
ARF4P18085 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
ARF4P18085 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms