Protein–RNA interactions for Protein: P17706

PTPN2, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 2, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN2P17706 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PTPN2P17706 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
PTPN2P17706 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PTPN2P17706 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PTPN2P17706 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PTPN2P17706 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PTPN2P17706 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PTPN2P17706 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PTPN2P17706 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PTPN2P17706 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PTPN2P17706 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PTPN2P17706 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PTPN2P17706 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PTPN2P17706 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PTPN2P17706 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PTPN2P17706 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PTPN2P17706 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PTPN2P17706 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PTPN2P17706 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PTPN2P17706 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PTPN2P17706 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PTPN2P17706 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PTPN2P17706 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PTPN2P17706 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PTPN2P17706 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PTPN2P17706 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PTPN2P17706 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PTPN2P17706 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PTPN2P17706 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PTPN2P17706 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PTPN2P17706 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.64■■■□□ 2.01
PTPN2P17706 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
PTPN2P17706 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
PTPN2P17706 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.01
PTPN2P17706 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PTPN2P17706 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
PTPN2P17706 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
PTPN2P17706 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
PTPN2P17706 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
PTPN2P17706 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
PTPN2P17706 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
PTPN2P17706 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
PTPN2P17706 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
PTPN2P17706 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
PTPN2P17706 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PTPN2P17706 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PTPN2P17706 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PTPN2P17706 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PTPN2P17706 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PTPN2P17706 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PTPN2P17706 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PTPN2P17706 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PTPN2P17706 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PTPN2P17706 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PTPN2P17706 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PTPN2P17706 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PTPN2P17706 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PTPN2P17706 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PTPN2P17706 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PTPN2P17706 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
PTPN2P17706 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PTPN2P17706 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PTPN2P17706 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PTPN2P17706 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PTPN2P17706 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
PTPN2P17706 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PTPN2P17706 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
PTPN2P17706 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
PTPN2P17706 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PTPN2P17706 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PTPN2P17706 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
PTPN2P17706 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PTPN2P17706 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PTPN2P17706 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PTPN2P17706 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PTPN2P17706 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PTPN2P17706 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PTPN2P17706 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PTPN2P17706 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PTPN2P17706 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PTPN2P17706 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PTPN2P17706 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PTPN2P17706 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PTPN2P17706 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
PTPN2P17706 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
PTPN2P17706 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PTPN2P17706 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PTPN2P17706 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
PTPN2P17706 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PTPN2P17706 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PTPN2P17706 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PTPN2P17706 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PTPN2P17706 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PTPN2P17706 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
PTPN2P17706 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PTPN2P17706 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PTPN2P17706 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PTPN2P17706 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PTPN2P17706 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PTPN2P17706 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms