Protein–RNA interactions for Protein: P15927

RPA2, Replication protein A 32 kDa subunit, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA2P15927 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPA2P15927 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPA2P15927 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPA2P15927 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPA2P15927 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPA2P15927 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPA2P15927 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPA2P15927 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RPA2P15927 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPA2P15927 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPA2P15927 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPA2P15927 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RPA2P15927 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RPA2P15927 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RPA2P15927 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RPA2P15927 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RPA2P15927 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RPA2P15927 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RPA2P15927 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RPA2P15927 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RPA2P15927 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RPA2P15927 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RPA2P15927 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RPA2P15927 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RPA2P15927 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RPA2P15927 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RPA2P15927 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RPA2P15927 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RPA2P15927 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RPA2P15927 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RPA2P15927 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RPA2P15927 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RPA2P15927 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RPA2P15927 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RPA2P15927 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RPA2P15927 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RPA2P15927 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RPA2P15927 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RPA2P15927 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RPA2P15927 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RPA2P15927 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
RPA2P15927 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RPA2P15927 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RPA2P15927 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RPA2P15927 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RPA2P15927 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RPA2P15927 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RPA2P15927 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RPA2P15927 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RPA2P15927 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RPA2P15927 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RPA2P15927 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RPA2P15927 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RPA2P15927 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RPA2P15927 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RPA2P15927 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RPA2P15927 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RPA2P15927 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RPA2P15927 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RPA2P15927 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RPA2P15927 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RPA2P15927 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RPA2P15927 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RPA2P15927 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RPA2P15927 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RPA2P15927 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
RPA2P15927 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RPA2P15927 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RPA2P15927 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RPA2P15927 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RPA2P15927 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RPA2P15927 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RPA2P15927 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RPA2P15927 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RPA2P15927 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RPA2P15927 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RPA2P15927 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RPA2P15927 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RPA2P15927 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RPA2P15927 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RPA2P15927 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RPA2P15927 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RPA2P15927 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RPA2P15927 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RPA2P15927 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RPA2P15927 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RPA2P15927 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RPA2P15927 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
RPA2P15927 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RPA2P15927 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RPA2P15927 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
RPA2P15927 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RPA2P15927 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RPA2P15927 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RPA2P15927 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RPA2P15927 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RPA2P15927 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RPA2P15927 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RPA2P15927 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RPA2P15927 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms