Protein–RNA interactions for Protein: P15924

DSP, Desmoplakin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSPP15924 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
DSPP15924 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
DSPP15924 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
DSPP15924 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
DSPP15924 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
DSPP15924 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
DSPP15924 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
DSPP15924 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
DSPP15924 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
DSPP15924 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
DSPP15924 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
DSPP15924 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
DSPP15924 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
DSPP15924 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
DSPP15924 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
DSPP15924 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
DSPP15924 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
DSPP15924 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
DSPP15924 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
DSPP15924 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
DSPP15924 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
DSPP15924 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
DSPP15924 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
DSPP15924 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
DSPP15924 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
DSPP15924 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
DSPP15924 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
DSPP15924 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
DSPP15924 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
DSPP15924 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
DSPP15924 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
DSPP15924 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
DSPP15924 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
DSPP15924 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
DSPP15924 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.59
DSPP15924 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
DSPP15924 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
DSPP15924 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
DSPP15924 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
DSPP15924 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
DSPP15924 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
DSPP15924 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
DSPP15924 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
DSPP15924 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
DSPP15924 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
DSPP15924 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
DSPP15924 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
DSPP15924 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
DSPP15924 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
DSPP15924 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
DSPP15924 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
DSPP15924 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
DSPP15924 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
DSPP15924 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
DSPP15924 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
DSPP15924 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
DSPP15924 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
DSPP15924 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
DSPP15924 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
DSPP15924 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
DSPP15924 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
DSPP15924 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
DSPP15924 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
DSPP15924 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
DSPP15924 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
DSPP15924 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
DSPP15924 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
DSPP15924 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
DSPP15924 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
DSPP15924 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
DSPP15924 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
DSPP15924 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
DSPP15924 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
DSPP15924 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
DSPP15924 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
DSPP15924 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
DSPP15924 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
DSPP15924 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
DSPP15924 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
DSPP15924 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
DSPP15924 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
DSPP15924 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
DSPP15924 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
DSPP15924 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
DSPP15924 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
DSPP15924 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
DSPP15924 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
DSPP15924 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
DSPP15924 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
DSPP15924 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
DSPP15924 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
DSPP15924 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
DSPP15924 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
DSPP15924 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
DSPP15924 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
DSPP15924 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
DSPP15924 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
DSPP15924 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
DSPP15924 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
DSPP15924 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms