Protein–RNA interactions for Protein: P15918

RAG1, V(D)J recombination-activating protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,043 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAG1P15918 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
RAG1P15918 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
RAG1P15918 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
RAG1P15918 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
RAG1P15918 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
RAG1P15918 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
RAG1P15918 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
RAG1P15918 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
RAG1P15918 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
RAG1P15918 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
RAG1P15918 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
RAG1P15918 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
RAG1P15918 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
RAG1P15918 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
RAG1P15918 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
RAG1P15918 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
RAG1P15918 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
RAG1P15918 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
RAG1P15918 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
RAG1P15918 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
RAG1P15918 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
RAG1P15918 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
RAG1P15918 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
RAG1P15918 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
RAG1P15918 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
RAG1P15918 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
RAG1P15918 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
RAG1P15918 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
RAG1P15918 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
RAG1P15918 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
RAG1P15918 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
RAG1P15918 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
RAG1P15918 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
RAG1P15918 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
RAG1P15918 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
RAG1P15918 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
RAG1P15918 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
RAG1P15918 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
RAG1P15918 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
RAG1P15918 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
RAG1P15918 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
RAG1P15918 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
RAG1P15918 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
RAG1P15918 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
RAG1P15918 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
RAG1P15918 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
RAG1P15918 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
RAG1P15918 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
RAG1P15918 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
RAG1P15918 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
RAG1P15918 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
RAG1P15918 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
RAG1P15918 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
RAG1P15918 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
RAG1P15918 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
RAG1P15918 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
RAG1P15918 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.25
RAG1P15918 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
RAG1P15918 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
RAG1P15918 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
RAG1P15918 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
RAG1P15918 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
RAG1P15918 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC29.1■■■□□ 2.25
RAG1P15918 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
RAG1P15918 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
RAG1P15918 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC29.09■■■□□ 2.25
RAG1P15918 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
RAG1P15918 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
RAG1P15918 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
RAG1P15918 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
RAG1P15918 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC29.06■■■□□ 2.24
RAG1P15918 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
RAG1P15918 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
RAG1P15918 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC29.05■■■□□ 2.24
RAG1P15918 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
RAG1P15918 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
RAG1P15918 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
RAG1P15918 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
RAG1P15918 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
RAG1P15918 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
RAG1P15918 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
RAG1P15918 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
RAG1P15918 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
RAG1P15918 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
RAG1P15918 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
RAG1P15918 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
RAG1P15918 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
RAG1P15918 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
RAG1P15918 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
RAG1P15918 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
RAG1P15918 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
RAG1P15918 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
RAG1P15918 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
RAG1P15918 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
RAG1P15918 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
RAG1P15918 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC28.96■■■□□ 2.23
RAG1P15918 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
RAG1P15918 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
RAG1P15918 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
RAG1P15918 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms