Protein–RNA interactions for Protein: P15056

BRAF, Serine/threonine-protein kinase B-raf, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRAFP15056 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
BRAFP15056 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
BRAFP15056 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
BRAFP15056 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
BRAFP15056 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
BRAFP15056 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
BRAFP15056 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
BRAFP15056 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
BRAFP15056 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
BRAFP15056 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
BRAFP15056 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
BRAFP15056 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
BRAFP15056 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
BRAFP15056 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
BRAFP15056 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
BRAFP15056 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
BRAFP15056 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
BRAFP15056 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
BRAFP15056 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
BRAFP15056 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
BRAFP15056 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
BRAFP15056 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
BRAFP15056 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
BRAFP15056 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
BRAFP15056 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
BRAFP15056 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
BRAFP15056 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
BRAFP15056 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
BRAFP15056 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
BRAFP15056 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
BRAFP15056 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
BRAFP15056 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
BRAFP15056 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
BRAFP15056 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
BRAFP15056 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
BRAFP15056 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
BRAFP15056 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
BRAFP15056 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
BRAFP15056 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
BRAFP15056 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
BRAFP15056 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
BRAFP15056 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
BRAFP15056 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
BRAFP15056 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
BRAFP15056 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
BRAFP15056 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
BRAFP15056 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
BRAFP15056 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
BRAFP15056 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
BRAFP15056 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
BRAFP15056 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
BRAFP15056 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
BRAFP15056 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
BRAFP15056 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
BRAFP15056 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
BRAFP15056 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
BRAFP15056 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
BRAFP15056 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
BRAFP15056 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
BRAFP15056 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
BRAFP15056 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
BRAFP15056 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
BRAFP15056 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
BRAFP15056 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
BRAFP15056 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
BRAFP15056 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
BRAFP15056 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
BRAFP15056 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
BRAFP15056 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
BRAFP15056 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
BRAFP15056 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
BRAFP15056 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
BRAFP15056 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
BRAFP15056 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
BRAFP15056 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
BRAFP15056 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
BRAFP15056 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
BRAFP15056 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
BRAFP15056 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
BRAFP15056 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
BRAFP15056 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
BRAFP15056 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
BRAFP15056 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
BRAFP15056 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
BRAFP15056 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
BRAFP15056 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
BRAFP15056 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
BRAFP15056 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
BRAFP15056 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
BRAFP15056 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
BRAFP15056 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
BRAFP15056 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
BRAFP15056 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
BRAFP15056 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
BRAFP15056 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
BRAFP15056 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
BRAFP15056 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
BRAFP15056 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
BRAFP15056 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
BRAFP15056 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms