Protein–RNA interactions for Protein: P14373

TRIM27, Zinc finger protein RFP, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM27P14373 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
TRIM27P14373 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
TRIM27P14373 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
TRIM27P14373 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
TRIM27P14373 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
TRIM27P14373 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC33.6■■■□□ 2.97
TRIM27P14373 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
TRIM27P14373 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
TRIM27P14373 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
TRIM27P14373 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
TRIM27P14373 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
TRIM27P14373 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
TRIM27P14373 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
TRIM27P14373 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
TRIM27P14373 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.55■■■□□ 2.96
TRIM27P14373 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.55■■■□□ 2.96
TRIM27P14373 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC33.54■■■□□ 2.96
TRIM27P14373 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC33.54■■■□□ 2.96
TRIM27P14373 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.54■■■□□ 2.96
TRIM27P14373 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC33.52■■■□□ 2.96
TRIM27P14373 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC33.52■■■□□ 2.96
TRIM27P14373 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
TRIM27P14373 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC33.51■■■□□ 2.95
TRIM27P14373 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
TRIM27P14373 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
TRIM27P14373 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
TRIM27P14373 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
TRIM27P14373 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC33.49■■■□□ 2.95
TRIM27P14373 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
TRIM27P14373 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
TRIM27P14373 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
TRIM27P14373 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
TRIM27P14373 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
TRIM27P14373 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC33.47■■■□□ 2.95
TRIM27P14373 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
TRIM27P14373 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
TRIM27P14373 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.95
TRIM27P14373 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
TRIM27P14373 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
TRIM27P14373 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
TRIM27P14373 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
TRIM27P14373 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC33.44■■■□□ 2.94
TRIM27P14373 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.43■■■□□ 2.94
TRIM27P14373 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
TRIM27P14373 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
TRIM27P14373 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
TRIM27P14373 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
TRIM27P14373 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
TRIM27P14373 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
TRIM27P14373 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
TRIM27P14373 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
TRIM27P14373 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
TRIM27P14373 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
TRIM27P14373 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
TRIM27P14373 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
TRIM27P14373 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
TRIM27P14373 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
TRIM27P14373 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.94
TRIM27P14373 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
TRIM27P14373 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC33.38■■■□□ 2.93
TRIM27P14373 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
TRIM27P14373 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
TRIM27P14373 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
TRIM27P14373 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
TRIM27P14373 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
TRIM27P14373 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC33.36■■■□□ 2.93
TRIM27P14373 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC33.35■■■□□ 2.93
TRIM27P14373 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC33.35■■■□□ 2.93
TRIM27P14373 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
TRIM27P14373 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
TRIM27P14373 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC33.34■■■□□ 2.93
TRIM27P14373 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
TRIM27P14373 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
TRIM27P14373 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
TRIM27P14373 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
TRIM27P14373 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
TRIM27P14373 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
TRIM27P14373 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
TRIM27P14373 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33.32■■■□□ 2.92
TRIM27P14373 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.32■■■□□ 2.92
TRIM27P14373 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC33.32■■■□□ 2.92
TRIM27P14373 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
TRIM27P14373 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
TRIM27P14373 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC33.31■■■□□ 2.92
TRIM27P14373 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
TRIM27P14373 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
TRIM27P14373 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
TRIM27P14373 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC33.29■■■□□ 2.92
TRIM27P14373 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
TRIM27P14373 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
TRIM27P14373 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
TRIM27P14373 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
TRIM27P14373 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
TRIM27P14373 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
TRIM27P14373 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
TRIM27P14373 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
TRIM27P14373 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
TRIM27P14373 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
TRIM27P14373 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC33.24■■■□□ 2.91
TRIM27P14373 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.6 ms