Protein–RNA interactions for Protein: P14317

HCLS1, Hematopoietic lineage cell-specific protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 486 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCLS1P14317 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
HCLS1P14317 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
HCLS1P14317 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC33.2■■■□□ 2.91
HCLS1P14317 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
HCLS1P14317 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
HCLS1P14317 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
HCLS1P14317 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
HCLS1P14317 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
HCLS1P14317 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC33.16■■■□□ 2.9
HCLS1P14317 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
HCLS1P14317 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
HCLS1P14317 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
HCLS1P14317 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
HCLS1P14317 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
HCLS1P14317 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
HCLS1P14317 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
HCLS1P14317 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
HCLS1P14317 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
HCLS1P14317 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
HCLS1P14317 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
HCLS1P14317 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
HCLS1P14317 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
HCLS1P14317 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
HCLS1P14317 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
HCLS1P14317 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
HCLS1P14317 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
HCLS1P14317 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
HCLS1P14317 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC33.09■■■□□ 2.89
HCLS1P14317 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC33.09■■■□□ 2.89
HCLS1P14317 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC33.09■■■□□ 2.89
HCLS1P14317 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
HCLS1P14317 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
HCLS1P14317 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
HCLS1P14317 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
HCLS1P14317 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC33.05■■■□□ 2.88
HCLS1P14317 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
HCLS1P14317 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
HCLS1P14317 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
HCLS1P14317 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
HCLS1P14317 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
HCLS1P14317 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.03■■■□□ 2.88
HCLS1P14317 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
HCLS1P14317 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
HCLS1P14317 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.03■■■□□ 2.88
HCLS1P14317 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
HCLS1P14317 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
HCLS1P14317 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
HCLS1P14317 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
HCLS1P14317 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC33.02■■■□□ 2.88
HCLS1P14317 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
HCLS1P14317 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC33.01■■■□□ 2.87
HCLS1P14317 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
HCLS1P14317 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC33.01■■■□□ 2.87
HCLS1P14317 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC33.01■■■□□ 2.87
HCLS1P14317 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC33■■■□□ 2.87
HCLS1P14317 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
HCLS1P14317 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
HCLS1P14317 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC32.97■■■□□ 2.87
HCLS1P14317 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
HCLS1P14317 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC32.95■■■□□ 2.87
HCLS1P14317 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC32.95■■■□□ 2.87
HCLS1P14317 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC32.95■■■□□ 2.87
HCLS1P14317 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC32.95■■■□□ 2.87
HCLS1P14317 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC32.95■■■□□ 2.87
HCLS1P14317 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC32.95■■■□□ 2.87
HCLS1P14317 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC32.95■■■□□ 2.87
HCLS1P14317 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC32.95■■■□□ 2.87
HCLS1P14317 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC32.95■■■□□ 2.87
HCLS1P14317 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC32.95■■■□□ 2.87
HCLS1P14317 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
HCLS1P14317 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
HCLS1P14317 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
HCLS1P14317 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
HCLS1P14317 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
HCLS1P14317 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
HCLS1P14317 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC32.91■■■□□ 2.86
HCLS1P14317 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
HCLS1P14317 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC32.91■■■□□ 2.86
HCLS1P14317 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC32.9■■■□□ 2.86
HCLS1P14317 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC32.9■■■□□ 2.86
HCLS1P14317 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC32.9■■■□□ 2.86
HCLS1P14317 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC32.89■■■□□ 2.86
HCLS1P14317 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC32.89■■■□□ 2.86
HCLS1P14317 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
HCLS1P14317 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC32.89■■■□□ 2.86
HCLS1P14317 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC32.89■■■□□ 2.86
HCLS1P14317 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
HCLS1P14317 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC32.87■■■□□ 2.85
HCLS1P14317 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC32.87■■■□□ 2.85
HCLS1P14317 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.87■■■□□ 2.85
HCLS1P14317 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.86■■■□□ 2.85
HCLS1P14317 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
HCLS1P14317 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC32.86■■■□□ 2.85
HCLS1P14317 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
HCLS1P14317 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
HCLS1P14317 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
HCLS1P14317 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
HCLS1P14317 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.84■■■□□ 2.85
HCLS1P14317 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC32.83■■■□□ 2.85
HCLS1P14317 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms