Protein–RNA interactions for Protein: P12643

BMP2, Bone morphogenetic protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BMP2P12643 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
BMP2P12643 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
BMP2P12643 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
BMP2P12643 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
BMP2P12643 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
BMP2P12643 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
BMP2P12643 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
BMP2P12643 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
BMP2P12643 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
BMP2P12643 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
BMP2P12643 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
BMP2P12643 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
BMP2P12643 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
BMP2P12643 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
BMP2P12643 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
BMP2P12643 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
BMP2P12643 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
BMP2P12643 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
BMP2P12643 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
BMP2P12643 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
BMP2P12643 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
BMP2P12643 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
BMP2P12643 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
BMP2P12643 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
BMP2P12643 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
BMP2P12643 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
BMP2P12643 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
BMP2P12643 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
BMP2P12643 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
BMP2P12643 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
BMP2P12643 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
BMP2P12643 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
BMP2P12643 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
BMP2P12643 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
BMP2P12643 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
BMP2P12643 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
BMP2P12643 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
BMP2P12643 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
BMP2P12643 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
BMP2P12643 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
BMP2P12643 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
BMP2P12643 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
BMP2P12643 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
BMP2P12643 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
BMP2P12643 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
BMP2P12643 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
BMP2P12643 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
BMP2P12643 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
BMP2P12643 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
BMP2P12643 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
BMP2P12643 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
BMP2P12643 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
BMP2P12643 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
BMP2P12643 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
BMP2P12643 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
BMP2P12643 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
BMP2P12643 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
BMP2P12643 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
BMP2P12643 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
BMP2P12643 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
BMP2P12643 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
BMP2P12643 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
BMP2P12643 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
BMP2P12643 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
BMP2P12643 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
BMP2P12643 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
BMP2P12643 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
BMP2P12643 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
BMP2P12643 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
BMP2P12643 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
BMP2P12643 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
BMP2P12643 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
BMP2P12643 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
BMP2P12643 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
BMP2P12643 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
BMP2P12643 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
BMP2P12643 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
BMP2P12643 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
BMP2P12643 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
BMP2P12643 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
BMP2P12643 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
BMP2P12643 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
BMP2P12643 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
BMP2P12643 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
BMP2P12643 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
BMP2P12643 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
BMP2P12643 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
BMP2P12643 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
BMP2P12643 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
BMP2P12643 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
BMP2P12643 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
BMP2P12643 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
BMP2P12643 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
BMP2P12643 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
BMP2P12643 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
BMP2P12643 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
BMP2P12643 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
BMP2P12643 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
BMP2P12643 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
BMP2P12643 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms