Protein–RNA interactions for Protein: P11487

FGF3, Fibroblast growth factor 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGF3P11487 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
FGF3P11487 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
FGF3P11487 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
FGF3P11487 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
FGF3P11487 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
FGF3P11487 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
FGF3P11487 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
FGF3P11487 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
FGF3P11487 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
FGF3P11487 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
FGF3P11487 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
FGF3P11487 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
FGF3P11487 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
FGF3P11487 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
FGF3P11487 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
FGF3P11487 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
FGF3P11487 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
FGF3P11487 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
FGF3P11487 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
FGF3P11487 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
FGF3P11487 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
FGF3P11487 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
FGF3P11487 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
FGF3P11487 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
FGF3P11487 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
FGF3P11487 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
FGF3P11487 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
FGF3P11487 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
FGF3P11487 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
FGF3P11487 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
FGF3P11487 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
FGF3P11487 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
FGF3P11487 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
FGF3P11487 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
FGF3P11487 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
FGF3P11487 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
FGF3P11487 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
FGF3P11487 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
FGF3P11487 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
FGF3P11487 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
FGF3P11487 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
FGF3P11487 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
FGF3P11487 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
FGF3P11487 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
FGF3P11487 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
FGF3P11487 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
FGF3P11487 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
FGF3P11487 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
FGF3P11487 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
FGF3P11487 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
FGF3P11487 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
FGF3P11487 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
FGF3P11487 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
FGF3P11487 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
FGF3P11487 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
FGF3P11487 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
FGF3P11487 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
FGF3P11487 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
FGF3P11487 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
FGF3P11487 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
FGF3P11487 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
FGF3P11487 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
FGF3P11487 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
FGF3P11487 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
FGF3P11487 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
FGF3P11487 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
FGF3P11487 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
FGF3P11487 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
FGF3P11487 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
FGF3P11487 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
FGF3P11487 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
FGF3P11487 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
FGF3P11487 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
FGF3P11487 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
FGF3P11487 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
FGF3P11487 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
FGF3P11487 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
FGF3P11487 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
FGF3P11487 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
FGF3P11487 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
FGF3P11487 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
FGF3P11487 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
FGF3P11487 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
FGF3P11487 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
FGF3P11487 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
FGF3P11487 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
FGF3P11487 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
FGF3P11487 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
FGF3P11487 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
FGF3P11487 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
FGF3P11487 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.76
FGF3P11487 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
FGF3P11487 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
FGF3P11487 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
FGF3P11487 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
FGF3P11487 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
FGF3P11487 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
FGF3P11487 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
FGF3P11487 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
FGF3P11487 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.6 ms