Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD7

PGA4, Pepsin A-4, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGA4P0DJD7 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PGA4P0DJD7 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PGA4P0DJD7 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PGA4P0DJD7 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PGA4P0DJD7 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PGA4P0DJD7 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
PGA4P0DJD7 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PGA4P0DJD7 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PGA4P0DJD7 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PGA4P0DJD7 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PGA4P0DJD7 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PGA4P0DJD7 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PGA4P0DJD7 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PGA4P0DJD7 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PGA4P0DJD7 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PGA4P0DJD7 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PGA4P0DJD7 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PGA4P0DJD7 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PGA4P0DJD7 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PGA4P0DJD7 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PGA4P0DJD7 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PGA4P0DJD7 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PGA4P0DJD7 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PGA4P0DJD7 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PGA4P0DJD7 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PGA4P0DJD7 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PGA4P0DJD7 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PGA4P0DJD7 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PGA4P0DJD7 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PGA4P0DJD7 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PGA4P0DJD7 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PGA4P0DJD7 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PGA4P0DJD7 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PGA4P0DJD7 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PGA4P0DJD7 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PGA4P0DJD7 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PGA4P0DJD7 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PGA4P0DJD7 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PGA4P0DJD7 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
PGA4P0DJD7 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PGA4P0DJD7 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PGA4P0DJD7 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PGA4P0DJD7 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PGA4P0DJD7 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PGA4P0DJD7 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PGA4P0DJD7 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PGA4P0DJD7 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PGA4P0DJD7 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PGA4P0DJD7 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PGA4P0DJD7 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PGA4P0DJD7 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PGA4P0DJD7 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PGA4P0DJD7 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PGA4P0DJD7 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PGA4P0DJD7 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PGA4P0DJD7 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PGA4P0DJD7 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PGA4P0DJD7 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PGA4P0DJD7 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PGA4P0DJD7 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PGA4P0DJD7 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PGA4P0DJD7 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PGA4P0DJD7 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PGA4P0DJD7 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PGA4P0DJD7 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PGA4P0DJD7 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PGA4P0DJD7 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
PGA4P0DJD7 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PGA4P0DJD7 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PGA4P0DJD7 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PGA4P0DJD7 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PGA4P0DJD7 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PGA4P0DJD7 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PGA4P0DJD7 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PGA4P0DJD7 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PGA4P0DJD7 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PGA4P0DJD7 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PGA4P0DJD7 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PGA4P0DJD7 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PGA4P0DJD7 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PGA4P0DJD7 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PGA4P0DJD7 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PGA4P0DJD7 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
PGA4P0DJD7 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PGA4P0DJD7 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PGA4P0DJD7 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PGA4P0DJD7 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PGA4P0DJD7 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PGA4P0DJD7 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PGA4P0DJD7 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PGA4P0DJD7 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PGA4P0DJD7 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PGA4P0DJD7 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PGA4P0DJD7 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PGA4P0DJD7 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PGA4P0DJD7 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PGA4P0DJD7 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PGA4P0DJD7 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PGA4P0DJD7 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PGA4P0DJD7 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.1 ms