Protein–RNA interactions for Protein: P0CX35

RPS4A, 40S ribosomal protein S4-A, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RPS4AP0CX35 CCT5YJR064W 1689 nt8.7□□□□□ -1.02
RPS4AP0CX35 SOL2YCR073W-A 948 nt8.7□□□□□ -1.02
RPS4AP0CX35 CPD1YGR247W 720 nt8.7□□□□□ -1.02
RPS4AP0CX35 TAT2YOL020W 1779 nt8.69□□□□□ -1.02
RPS4AP0CX35 Q0144Q0144 330 nt8.69□□□□□ -1.02
RPS4AP0CX35 HEL2YDR266C 1920 nt8.69□□□□□ -1.02
RPS4AP0CX35 AIM1YAL046C 357 nt8.68□□□□□ -1.02
RPS4AP0CX35 GID8YMR135C 1368 nt8.68□□□□□ -1.02
RPS4AP0CX35 YMR209CYMR209C 1374 nt8.68□□□□□ -1.02
RPS4AP0CX35 TPS1YBR126C 1488 nt8.67□□□□□ -1.02
RPS4AP0CX35 RIB7YBR153W 735 nt8.67□□□□□ -1.02
RPS4AP0CX35 OYE2YHR179W 1203 nt8.66□□□□□ -1.02
RPS4AP0CX35 EAF3YPR023C 1206 nt8.66□□□□□ -1.02
RPS4AP0CX35 SNZ1YMR096W 894 nt8.65□□□□□ -1.02
RPS4AP0CX35 ASP3-1YLR155C 1089 nt8.64□□□□□ -1.03
RPS4AP0CX35 ASP3-2YLR157C 1089 nt8.64□□□□□ -1.03
RPS4AP0CX35 ASP3-3YLR158C 1089 nt8.64□□□□□ -1.03
RPS4AP0CX35 ASP3-4YLR160C 1089 nt8.64□□□□□ -1.03
RPS4AP0CX35 YTH1YPR107C 627 nt8.64□□□□□ -1.03
RPS4AP0CX35 YDR455CYDR455C 309 nt8.63□□□□□ -1.03
RPS4AP0CX35 LSM5YER146W 282 nt8.63□□□□□ -1.03
RPS4AP0CX35 MRS6YOR370C 1812 nt8.63□□□□□ -1.03
RPS4AP0CX35 YLR046CYLR046C 813 nt8.62□□□□□ -1.03
RPS4AP0CX35 ZAP1YJL056C 2643 nt8.62□□□□□ -1.03
RPS4AP0CX35 YKL133CYKL133C 1392 nt8.61□□□□□ -1.03
RPS4AP0CX35 DDI1YER143W 1287 nt8.6□□□□□ -1.03
RPS4AP0CX35 ESS1YJR017C 513 nt8.6□□□□□ -1.03
RPS4AP0CX35 tS(GCU)LtS(GCU)L 80 nt8.59□□□□□ -1.03
RPS4AP0CX35 THI72YOR192C 1800 nt8.59□□□□□ -1.03
RPS4AP0CX35 YPR126CYPR126C 309 nt8.58□□□□□ -1.04
RPS4AP0CX35 ENT4YLL038C 744 nt8.57□□□□□ -1.04
RPS4AP0CX35 TMA23YMR269W 636 nt8.57□□□□□ -1.04
RPS4AP0CX35 PET20YPL159C 762 nt8.57□□□□□ -1.04
RPS4AP0CX35 DAK2YFL053W 1776 nt8.57□□□□□ -1.04
RPS4AP0CX35 YHR219WYHR219W 1875 nt8.56□□□□□ -1.04
RPS4AP0CX35 BNS1YGR230W 414 nt8.56□□□□□ -1.04
RPS4AP0CX35 SKG1YKR100C 1068 nt8.55□□□□□ -1.04
RPS4AP0CX35 LSR1LSR1 1175 nt8.55□□□□□ -1.04
RPS4AP0CX35 ODC1YPL134C 933 nt8.55□□□□□ -1.04
RPS4AP0CX35 DLD3YEL071W 1491 nt8.55□□□□□ -1.04
RPS4AP0CX35 ERG13YML126C 1476 nt8.55□□□□□ -1.04
RPS4AP0CX35 PGC1YPL206C 966 nt8.53□□□□□ -1.04
RPS4AP0CX35 BSP1YPR171W 1731 nt8.53□□□□□ -1.04
RPS4AP0CX35 CTI6YPL181W 1521 nt8.52□□□□□ -1.05
RPS4AP0CX35 ITR2YOL103W 1830 nt8.52□□□□□ -1.05
RPS4AP0CX35 snR78snR78 87 nt8.51□□□□□ -1.05
RPS4AP0CX35 PAU5YFL020C 369 nt8.51□□□□□ -1.05
RPS4AP0CX35 IMO32YGR031W 1029 nt8.51□□□□□ -1.05
RPS4AP0CX35 TAF13YML098W 504 nt8.51□□□□□ -1.05
RPS4AP0CX35 SSL2YIL143C 2532 nt8.5□□□□□ -1.05
RPS4AP0CX35 REC114YMR133W 1287 nt8.5□□□□□ -1.05
RPS4AP0CX35 MHF1YOL086W-A 273 nt8.5□□□□□ -1.05
RPS4AP0CX35 DMA2YNL116W 1569 nt8.49□□□□□ -1.05
RPS4AP0CX35 TIP1YBR067C 633 nt8.49□□□□□ -1.05
RPS4AP0CX35 PSD1YNL169C 1503 nt8.49□□□□□ -1.05
RPS4AP0CX35 MAE1YKL029C 2010 nt8.48□□□□□ -1.05
RPS4AP0CX35 PUS5YLR165C 765 nt8.48□□□□□ -1.05
RPS4AP0CX35 YMR262WYMR262W 942 nt8.48□□□□□ -1.05
RPS4AP0CX35 IML3YBR107C 738 nt8.48□□□□□ -1.05
RPS4AP0CX35 YBR232CYBR232C 360 nt8.47□□□□□ -1.05
RPS4AP0CX35 RPD3YNL330C 1302 nt8.47□□□□□ -1.05
RPS4AP0CX35 MET2YNL277W 1461 nt8.46□□□□□ -1.05
RPS4AP0CX35 ADE8YDR408C 645 nt8.46□□□□□ -1.06
RPS4AP0CX35 TIM44YIL022W 1296 nt8.46□□□□□ -1.06
RPS4AP0CX35 POT1YIL160C 1254 nt8.46□□□□□ -1.06
RPS4AP0CX35 STP3YLR375W 1032 nt8.46□□□□□ -1.06
RPS4AP0CX35 SAC7YDR389W 1965 nt8.46□□□□□ -1.06
RPS4AP0CX35 YFR036W-AYFR036W-A 651 nt8.45□□□□□ -1.06
RPS4AP0CX35 SEN2YLR105C 1134 nt8.45□□□□□ -1.06
RPS4AP0CX35 RRT8YOL048C 1029 nt8.45□□□□□ -1.06
RPS4AP0CX35 VMA11YPL234C 495 nt8.45□□□□□ -1.06
RPS4AP0CX35 CYT1YOR065W 930 nt8.44□□□□□ -1.06
RPS4AP0CX35 FAF1YIL019W 1041 nt8.43□□□□□ -1.06
RPS4AP0CX35 ELO1YJL196C 933 nt8.43□□□□□ -1.06
RPS4AP0CX35 NAP1YKR048C 1254 nt8.43□□□□□ -1.06
RPS4AP0CX35 ATG17YLR423C 1254 nt8.43□□□□□ -1.06
RPS4AP0CX35 APS2YJR058C 444 nt8.42□□□□□ -1.06
RPS4AP0CX35 CWP2YKL096W-A 279 nt8.42□□□□□ -1.06
RPS4AP0CX35 GID7YCL039W 2238 nt8.42□□□□□ -1.06
RPS4AP0CX35 NIF3YGL221C 867 nt8.41□□□□□ -1.06
RPS4AP0CX35 FHN1YGR131W 525 nt8.41□□□□□ -1.06
RPS4AP0CX35 SPS100YHR139C 981 nt8.41□□□□□ -1.06
RPS4AP0CX35 YJR114WYJR114W 393 nt8.41□□□□□ -1.06
RPS4AP0CX35 MDM35YKL053C-A 261 nt8.41□□□□□ -1.06
RPS4AP0CX35 TUB4YLR212C 1422 nt8.4□□□□□ -1.06
RPS4AP0CX35 YCR099CYCR099C 468 nt8.4□□□□□ -1.06
RPS4AP0CX35 GSF2YML048W 1212 nt8.4□□□□□ -1.06
RPS4AP0CX35 SNX3YOR357C 489 nt8.4□□□□□ -1.06
RPS4AP0CX35 YJL107CYJL107C 1164 nt8.39□□□□□ -1.07
RPS4AP0CX35 YNR064CYNR064C 873 nt8.39□□□□□ -1.07
RPS4AP0CX35 ACO2YJL200C 2370 nt8.39□□□□□ -1.07
RPS4AP0CX35 YDR510C-AYDR510C-A 117 nt8.36□□□□□ -1.07
RPS4AP0CX35 OPI3YJR073C 621 nt8.36□□□□□ -1.07
RPS4AP0CX35 RPC31YNL151C 756 nt8.36□□□□□ -1.07
RPS4AP0CX35 YNR068CYNR068C 819 nt8.36□□□□□ -1.07
RPS4AP0CX35 THP3YPR045C 1413 nt8.36□□□□□ -1.07
RPS4AP0CX35 HXT10YFL011W 1641 nt8.36□□□□□ -1.07
RPS4AP0CX35 TVP23YDR084C 600 nt8.35□□□□□ -1.07
RPS4AP0CX35 URE2YNL229C 1065 nt8.35□□□□□ -1.07
RPS4AP0CX35 PUP1YOR157C 786 nt8.35□□□□□ -1.07
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