Protein–RNA interactions for Protein: P0CW24

PNMA6A, Paraneoplastic antigen-like protein 6A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA6AP0CW24 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PNMA6AP0CW24 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
PNMA6AP0CW24 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PNMA6AP0CW24 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
PNMA6AP0CW24 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PNMA6AP0CW24 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PNMA6AP0CW24 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PNMA6AP0CW24 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PNMA6AP0CW24 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PNMA6AP0CW24 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
PNMA6AP0CW24 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PNMA6AP0CW24 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PNMA6AP0CW24 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PNMA6AP0CW24 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
PNMA6AP0CW24 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PNMA6AP0CW24 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PNMA6AP0CW24 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PNMA6AP0CW24 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PNMA6AP0CW24 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PNMA6AP0CW24 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PNMA6AP0CW24 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
PNMA6AP0CW24 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PNMA6AP0CW24 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PNMA6AP0CW24 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PNMA6AP0CW24 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
PNMA6AP0CW24 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
PNMA6AP0CW24 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
PNMA6AP0CW24 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
PNMA6AP0CW24 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PNMA6AP0CW24 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PNMA6AP0CW24 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PNMA6AP0CW24 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PNMA6AP0CW24 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PNMA6AP0CW24 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PNMA6AP0CW24 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PNMA6AP0CW24 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PNMA6AP0CW24 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PNMA6AP0CW24 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PNMA6AP0CW24 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PNMA6AP0CW24 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PNMA6AP0CW24 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PNMA6AP0CW24 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PNMA6AP0CW24 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PNMA6AP0CW24 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
PNMA6AP0CW24 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PNMA6AP0CW24 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PNMA6AP0CW24 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PNMA6AP0CW24 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PNMA6AP0CW24 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PNMA6AP0CW24 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PNMA6AP0CW24 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PNMA6AP0CW24 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PNMA6AP0CW24 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PNMA6AP0CW24 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PNMA6AP0CW24 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PNMA6AP0CW24 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PNMA6AP0CW24 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PNMA6AP0CW24 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PNMA6AP0CW24 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PNMA6AP0CW24 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PNMA6AP0CW24 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PNMA6AP0CW24 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PNMA6AP0CW24 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PNMA6AP0CW24 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PNMA6AP0CW24 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PNMA6AP0CW24 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PNMA6AP0CW24 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
PNMA6AP0CW24 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PNMA6AP0CW24 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PNMA6AP0CW24 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PNMA6AP0CW24 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PNMA6AP0CW24 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PNMA6AP0CW24 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PNMA6AP0CW24 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PNMA6AP0CW24 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PNMA6AP0CW24 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PNMA6AP0CW24 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PNMA6AP0CW24 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
PNMA6AP0CW24 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PNMA6AP0CW24 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
PNMA6AP0CW24 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
PNMA6AP0CW24 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PNMA6AP0CW24 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PNMA6AP0CW24 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PNMA6AP0CW24 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PNMA6AP0CW24 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PNMA6AP0CW24 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PNMA6AP0CW24 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PNMA6AP0CW24 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PNMA6AP0CW24 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
PNMA6AP0CW24 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PNMA6AP0CW24 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PNMA6AP0CW24 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PNMA6AP0CW24 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PNMA6AP0CW24 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PNMA6AP0CW24 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PNMA6AP0CW24 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PNMA6AP0CW24 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PNMA6AP0CW24 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PNMA6AP0CW24 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms