Protein–RNA interactions for Protein: P0C7W6

CCDC172, Coiled-coil domain-containing protein 172, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC172P0C7W6 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CCDC172P0C7W6 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CCDC172P0C7W6 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CCDC172P0C7W6 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CCDC172P0C7W6 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CCDC172P0C7W6 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CCDC172P0C7W6 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CCDC172P0C7W6 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
CCDC172P0C7W6 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CCDC172P0C7W6 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CCDC172P0C7W6 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CCDC172P0C7W6 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CCDC172P0C7W6 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CCDC172P0C7W6 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
CCDC172P0C7W6 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CCDC172P0C7W6 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CCDC172P0C7W6 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CCDC172P0C7W6 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CCDC172P0C7W6 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CCDC172P0C7W6 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CCDC172P0C7W6 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CCDC172P0C7W6 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CCDC172P0C7W6 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CCDC172P0C7W6 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCDC172P0C7W6 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CCDC172P0C7W6 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
CCDC172P0C7W6 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CCDC172P0C7W6 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CCDC172P0C7W6 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCDC172P0C7W6 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCDC172P0C7W6 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCDC172P0C7W6 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCDC172P0C7W6 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCDC172P0C7W6 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
CCDC172P0C7W6 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCDC172P0C7W6 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
CCDC172P0C7W6 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
CCDC172P0C7W6 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CCDC172P0C7W6 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CCDC172P0C7W6 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CCDC172P0C7W6 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
CCDC172P0C7W6 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CCDC172P0C7W6 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CCDC172P0C7W6 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CCDC172P0C7W6 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCDC172P0C7W6 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCDC172P0C7W6 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCDC172P0C7W6 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCDC172P0C7W6 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCDC172P0C7W6 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCDC172P0C7W6 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCDC172P0C7W6 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCDC172P0C7W6 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCDC172P0C7W6 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCDC172P0C7W6 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCDC172P0C7W6 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CCDC172P0C7W6 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CCDC172P0C7W6 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CCDC172P0C7W6 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CCDC172P0C7W6 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CCDC172P0C7W6 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CCDC172P0C7W6 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC28■■■□□ 2.07
CCDC172P0C7W6 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CCDC172P0C7W6 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCDC172P0C7W6 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCDC172P0C7W6 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCDC172P0C7W6 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCDC172P0C7W6 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCDC172P0C7W6 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CCDC172P0C7W6 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CCDC172P0C7W6 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CCDC172P0C7W6 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CCDC172P0C7W6 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CCDC172P0C7W6 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CCDC172P0C7W6 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CCDC172P0C7W6 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CCDC172P0C7W6 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CCDC172P0C7W6 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CCDC172P0C7W6 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CCDC172P0C7W6 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCDC172P0C7W6 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCDC172P0C7W6 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CCDC172P0C7W6 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
CCDC172P0C7W6 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CCDC172P0C7W6 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CCDC172P0C7W6 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CCDC172P0C7W6 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCDC172P0C7W6 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCDC172P0C7W6 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCDC172P0C7W6 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCDC172P0C7W6 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CCDC172P0C7W6 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CCDC172P0C7W6 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CCDC172P0C7W6 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CCDC172P0C7W6 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CCDC172P0C7W6 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CCDC172P0C7W6 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CCDC172P0C7W6 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
CCDC172P0C7W6 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCDC172P0C7W6 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.6 ms