Protein–RNA interactions for Protein: P0C7H9

USP17L7, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L7P0C7H9 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
USP17L7P0C7H9 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
USP17L7P0C7H9 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
USP17L7P0C7H9 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
USP17L7P0C7H9 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
USP17L7P0C7H9 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
USP17L7P0C7H9 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
USP17L7P0C7H9 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
USP17L7P0C7H9 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
USP17L7P0C7H9 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
USP17L7P0C7H9 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
USP17L7P0C7H9 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
USP17L7P0C7H9 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
USP17L7P0C7H9 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
USP17L7P0C7H9 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
USP17L7P0C7H9 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
USP17L7P0C7H9 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
USP17L7P0C7H9 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
USP17L7P0C7H9 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
USP17L7P0C7H9 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
USP17L7P0C7H9 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
USP17L7P0C7H9 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
USP17L7P0C7H9 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
USP17L7P0C7H9 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
USP17L7P0C7H9 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
USP17L7P0C7H9 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
USP17L7P0C7H9 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
USP17L7P0C7H9 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
USP17L7P0C7H9 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
USP17L7P0C7H9 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC27.74■■■□□ 2.03
USP17L7P0C7H9 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
USP17L7P0C7H9 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
USP17L7P0C7H9 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
USP17L7P0C7H9 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
USP17L7P0C7H9 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
USP17L7P0C7H9 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
USP17L7P0C7H9 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
USP17L7P0C7H9 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
USP17L7P0C7H9 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
USP17L7P0C7H9 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
USP17L7P0C7H9 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
USP17L7P0C7H9 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
USP17L7P0C7H9 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
USP17L7P0C7H9 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
USP17L7P0C7H9 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
USP17L7P0C7H9 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
USP17L7P0C7H9 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
USP17L7P0C7H9 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
USP17L7P0C7H9 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
USP17L7P0C7H9 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
USP17L7P0C7H9 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
USP17L7P0C7H9 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
USP17L7P0C7H9 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
USP17L7P0C7H9 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
USP17L7P0C7H9 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
USP17L7P0C7H9 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
USP17L7P0C7H9 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
USP17L7P0C7H9 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
USP17L7P0C7H9 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
USP17L7P0C7H9 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
USP17L7P0C7H9 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
USP17L7P0C7H9 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
USP17L7P0C7H9 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
USP17L7P0C7H9 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
USP17L7P0C7H9 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
USP17L7P0C7H9 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
USP17L7P0C7H9 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
USP17L7P0C7H9 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
USP17L7P0C7H9 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
USP17L7P0C7H9 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
USP17L7P0C7H9 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
USP17L7P0C7H9 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
USP17L7P0C7H9 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
USP17L7P0C7H9 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
USP17L7P0C7H9 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
USP17L7P0C7H9 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
USP17L7P0C7H9 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
USP17L7P0C7H9 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
USP17L7P0C7H9 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
USP17L7P0C7H9 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
USP17L7P0C7H9 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
USP17L7P0C7H9 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
USP17L7P0C7H9 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.53■■■□□ 2
USP17L7P0C7H9 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
USP17L7P0C7H9 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
USP17L7P0C7H9 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
USP17L7P0C7H9 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
USP17L7P0C7H9 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
USP17L7P0C7H9 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
USP17L7P0C7H9 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
USP17L7P0C7H9 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
USP17L7P0C7H9 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
USP17L7P0C7H9 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
USP17L7P0C7H9 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
USP17L7P0C7H9 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
USP17L7P0C7H9 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
USP17L7P0C7H9 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
USP17L7P0C7H9 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
USP17L7P0C7H9 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
USP17L7P0C7H9 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms