Protein–RNA interactions for Protein: P09936

UCHL1, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase isozyme L1, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UCHL1P09936 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
UCHL1P09936 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
UCHL1P09936 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
UCHL1P09936 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
UCHL1P09936 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
UCHL1P09936 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
UCHL1P09936 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
UCHL1P09936 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
UCHL1P09936 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
UCHL1P09936 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
UCHL1P09936 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
UCHL1P09936 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
UCHL1P09936 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
UCHL1P09936 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
UCHL1P09936 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
UCHL1P09936 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
UCHL1P09936 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
UCHL1P09936 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
UCHL1P09936 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
UCHL1P09936 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
UCHL1P09936 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
UCHL1P09936 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
UCHL1P09936 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
UCHL1P09936 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
UCHL1P09936 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
UCHL1P09936 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
UCHL1P09936 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
UCHL1P09936 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
UCHL1P09936 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
UCHL1P09936 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
UCHL1P09936 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
UCHL1P09936 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
UCHL1P09936 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
UCHL1P09936 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
UCHL1P09936 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
UCHL1P09936 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
UCHL1P09936 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
UCHL1P09936 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
UCHL1P09936 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
UCHL1P09936 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
UCHL1P09936 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
UCHL1P09936 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
UCHL1P09936 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
UCHL1P09936 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
UCHL1P09936 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
UCHL1P09936 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
UCHL1P09936 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
UCHL1P09936 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
UCHL1P09936 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
UCHL1P09936 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
UCHL1P09936 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
UCHL1P09936 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
UCHL1P09936 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
UCHL1P09936 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
UCHL1P09936 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
UCHL1P09936 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
UCHL1P09936 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
UCHL1P09936 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
UCHL1P09936 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
UCHL1P09936 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
UCHL1P09936 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
UCHL1P09936 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
UCHL1P09936 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
UCHL1P09936 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
UCHL1P09936 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
UCHL1P09936 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
UCHL1P09936 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
UCHL1P09936 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
UCHL1P09936 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
UCHL1P09936 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
UCHL1P09936 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
UCHL1P09936 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
UCHL1P09936 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
UCHL1P09936 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
UCHL1P09936 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
UCHL1P09936 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
UCHL1P09936 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
UCHL1P09936 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
UCHL1P09936 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
UCHL1P09936 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
UCHL1P09936 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
UCHL1P09936 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UCHL1P09936 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
UCHL1P09936 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
UCHL1P09936 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
UCHL1P09936 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UCHL1P09936 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UCHL1P09936 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
UCHL1P09936 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
UCHL1P09936 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
UCHL1P09936 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UCHL1P09936 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
UCHL1P09936 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UCHL1P09936 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
UCHL1P09936 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
UCHL1P09936 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
UCHL1P09936 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
UCHL1P09936 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
UCHL1P09936 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UCHL1P09936 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms