Protein–RNA interactions for Protein: P09496

CLTA, Clathrin light chain A, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTAP09496 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
CLTAP09496 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CLTAP09496 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CLTAP09496 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CLTAP09496 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CLTAP09496 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CLTAP09496 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CLTAP09496 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CLTAP09496 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CLTAP09496 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CLTAP09496 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CLTAP09496 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CLTAP09496 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CLTAP09496 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CLTAP09496 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CLTAP09496 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
CLTAP09496 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CLTAP09496 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CLTAP09496 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CLTAP09496 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CLTAP09496 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CLTAP09496 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CLTAP09496 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CLTAP09496 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CLTAP09496 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CLTAP09496 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
CLTAP09496 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CLTAP09496 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
CLTAP09496 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CLTAP09496 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CLTAP09496 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CLTAP09496 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
CLTAP09496 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CLTAP09496 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CLTAP09496 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CLTAP09496 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CLTAP09496 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CLTAP09496 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CLTAP09496 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CLTAP09496 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CLTAP09496 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CLTAP09496 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CLTAP09496 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CLTAP09496 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CLTAP09496 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CLTAP09496 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CLTAP09496 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CLTAP09496 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CLTAP09496 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
CLTAP09496 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CLTAP09496 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
CLTAP09496 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CLTAP09496 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CLTAP09496 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
CLTAP09496 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CLTAP09496 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CLTAP09496 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CLTAP09496 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CLTAP09496 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CLTAP09496 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CLTAP09496 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CLTAP09496 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CLTAP09496 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CLTAP09496 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CLTAP09496 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CLTAP09496 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CLTAP09496 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CLTAP09496 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
CLTAP09496 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
CLTAP09496 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CLTAP09496 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
CLTAP09496 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
CLTAP09496 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CLTAP09496 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CLTAP09496 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CLTAP09496 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
CLTAP09496 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CLTAP09496 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CLTAP09496 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CLTAP09496 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CLTAP09496 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CLTAP09496 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CLTAP09496 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CLTAP09496 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CLTAP09496 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CLTAP09496 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CLTAP09496 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CLTAP09496 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CLTAP09496 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
CLTAP09496 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CLTAP09496 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CLTAP09496 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CLTAP09496 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CLTAP09496 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CLTAP09496 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CLTAP09496 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CLTAP09496 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CLTAP09496 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CLTAP09496 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CLTAP09496 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 546.6 ms