Protein–RNA interactions for Protein: P08651

NFIC, Nuclear factor 1 C-type, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFICP08651 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
NFICP08651 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NFICP08651 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
NFICP08651 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
NFICP08651 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
NFICP08651 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
NFICP08651 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
NFICP08651 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
NFICP08651 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
NFICP08651 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
NFICP08651 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
NFICP08651 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
NFICP08651 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
NFICP08651 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
NFICP08651 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
NFICP08651 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
NFICP08651 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
NFICP08651 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
NFICP08651 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
NFICP08651 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
NFICP08651 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
NFICP08651 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
NFICP08651 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
NFICP08651 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
NFICP08651 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
NFICP08651 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
NFICP08651 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
NFICP08651 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
NFICP08651 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
NFICP08651 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NFICP08651 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
NFICP08651 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
NFICP08651 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
NFICP08651 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
NFICP08651 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
NFICP08651 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
NFICP08651 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
NFICP08651 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
NFICP08651 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
NFICP08651 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
NFICP08651 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
NFICP08651 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
NFICP08651 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
NFICP08651 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
NFICP08651 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
NFICP08651 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
NFICP08651 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
NFICP08651 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
NFICP08651 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
NFICP08651 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
NFICP08651 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
NFICP08651 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
NFICP08651 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
NFICP08651 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
NFICP08651 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
NFICP08651 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
NFICP08651 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
NFICP08651 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
NFICP08651 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
NFICP08651 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
NFICP08651 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NFICP08651 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NFICP08651 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NFICP08651 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NFICP08651 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NFICP08651 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NFICP08651 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
NFICP08651 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
NFICP08651 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
NFICP08651 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
NFICP08651 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
NFICP08651 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
NFICP08651 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NFICP08651 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
NFICP08651 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
NFICP08651 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NFICP08651 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
NFICP08651 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
NFICP08651 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
NFICP08651 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NFICP08651 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NFICP08651 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC28.23■■■□□ 2.11
NFICP08651 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NFICP08651 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
NFICP08651 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
NFICP08651 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
NFICP08651 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
NFICP08651 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
NFICP08651 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
NFICP08651 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NFICP08651 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NFICP08651 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
NFICP08651 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
NFICP08651 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
NFICP08651 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NFICP08651 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NFICP08651 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
NFICP08651 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NFICP08651 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
NFICP08651 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.3 ms